Орден Христа был официально учрежден королем Португалии Динишем I 14 августа 1318 г. в качестве военно-монашеского (духовно-рыцарского, или религиозного военного) Ордена. Первоначально король Диниш отдал Орден Христа под покровительство Авизского Ордена Святого Бенедикта (Сан Бенто ди Авиш). 14–15 марта 1319 г. папа римский Иоанн XXII утвердил Устав Ордена Христа и порядок приема в новое духовнорыцарское братство, издав с этой целью специальную буллу (торжественное послание) «Ad es quibus». Уцелевшие владения и прочее имущество упраздненного Ордена Христа и Храма, находившиеся на территории королевств Португалия и Альгарвия, стали основой благосостояния новоучрежденного Ордена Христа. По рекомендации короля Диниша I папа Иоанн XXII назначил первым Великим Магистром Ордена Христа португальского аристократа дома Жила Мартинша (или Мартиниша), являвшегося в прошлом рыцарем военно-монашеского Авизского Ордена Святого Бенедикта (отпочковавшегося от духовно-рыцарского Ордена Калатравы).
Новому Ордену Христа был дан устав монашеского Ордена цистерцианцев (под патронажем которого был в свое время учрежден Орден Христа и Храма Соломонова), в его варианте, разработанном для Ордена Калатравы и требовавшем соблюдения членами Ордена 3 монашеских обетов: нестяжания (бедности), целомудрия (безбрачия) и послушания. Право наказания провинившихся членов Ордена Христа было предоставлено приору (настоятелю) Алькобакского монастыря Ордена цистерцианцев («братии белого облачения»). При утверждении Ордена Христа папа римский выдвинул условие, послужившее в будущем основой для раскола Ордена Христа на португальскую и папскую ветвь. Папское условие заключалось в том, что римский понтифик выговорил себе и своим преемникам на Престоле Святого Петра право участвовать в управлении Орденом Христа и право на посвящение кандидатов в рыцари Ордена («аспирантов»). Как бы то ни было, утверждение Ордена Христа папским престолом в течение долгого времени гарантировало соблюдение интересов португальской короны. Кроме того, в Португалии появился новый, собственный военно-монашеский Орден, продолжавший миссию упраздненного папским престолом Ордена Христа и Храма в деле борьбы с неверными, но уже не имеющий международного подчинения. Первоначально резиденция главы рыцарей Ордена Христа располагалась в замке Каштру Марим (Морим), расположенном в пограничной с маврами провинции Альгарвы, но в 1357 г., при шестом Великом Магистре рыцарей Христа, доме Нуньо Родригише, резиденция, в целях более эффективного отражения мавританских набегов на христианские земли, была перенесена в отбитый у «мавров» старинный замок-монастырь (прецепторию) Ордена Христа и Храма, расположенный в Томаре, неподалеку от Сантарена. Своими последующими действиями Орден Христа, или Орден Томара (порт.: Ordem de Tomar), как его стали называть по новой резиденции Великого Магистра рыцарей Христа, вписал немало славных, героических страниц в историю упорной и кровавой борьбы христианских народов Иберийского полуострова против мавританской угрозы.
В рыцари Ордена Христа могли быть посвящены только люди благородного (дворянского) происхождения, принимавшие участие в военных действиях против магометан в течение, по крайней мере, 3 лет. При посвящении в рыцари Христа аспиранты приносили 3 упомянутых выше монашеских обета: нестяжания, целомудрия и послушания. Официальное одеяние принявшего постриг воина-монаха Ордена Христа было белого цвета с красным тамплиерским уширенным крестом (расширения на концах орденского креста, так называемые «иерихонские трубы», были, как мы уже знаем, дарованы папским престолом членам Ордена Христа и Храма за отвагу, проявленную ими при взятии сарацинской крепости Аскалона в Святой Земле — в знак того, что стены Аскалона не устояли перед отвагой тамплиеров, так же, как стены ветхозаветного Иерихона не устояли перед трубными звуками воинства библейского пророка Иисуса Навина). На этот красный «храмовнический» крест членов Ордена Христа был наложен более узкий прямой крест белого цвета (в знак того, что рыцари Христа — по крайней мере, в Португалии! — чисты от обвинений, возведенных на «бедных рыцарей Христа и Храма» французским королем и папой Климентом V).
В конце XV в. и в XVI в. Орден Христа, подобно другим духовно-рыцарским Орденам, боровшимся с неверными на Иберийском полуострове, претерпел целый ряд изменений. Так, в конце XV в. папой римским Александром VI Борджа (1492–1503) были отменены 2 древних, уже почти забытых к описываемому времени, орденских обета нестяжания и целомудрия. Отмена этих 2 чисто монашеских обетов в немалой степени способствовала последующей секуляризации Ордена Христа (то есть приданию ему чисто светского характера династического рыцарского Ордена португальской короны). Но, несмотря на отмену этих обетов, Орден Христа еще долго сохранял свой, в сущности, духовно-рыцарский характер, ибо по-прежнему числил в своих рядах как рыцарей, так и нищенствующих монахов.
Должность Великого Магистра (Гран Мештри) Ордена Христа долгое время оставалась, как и в других рыцарских и духовных Орденах, выборной. Однако в 1417 г., после кончины Великого Магистра дома Лопо Диаша ди Соуза, король Португалии предложил избрать не новым Магистром, а «комендантом» («управителем») Ордена Христа своего сына — инфанта дома Энрике Навигатора, или, точнее, Энрики Навигадора (более известного у нас в России под именем «Генриха Мореплавателя»). Папа римский согласился с королевским предложением, и в 1420 г. управление Орденом Христа было передано дому Энрике. С этого времени и до 1551 г. управление Орденом Христа осуществлялось членами королевской семьи. Так выборного главу Ордена Христа, Верховного Магистра, сменил назначаемым королем и несменяемый «комендант». Это обеспечило португальской короне постоянный и надежный контроль над Орденом Христа, хотя папский престол продолжал рассматривать Орден Христа в качестве чисто военно-монашеского (религиозного военного) учреждения и субъекта исключительно церковного права.
Прославившая Энрике Навигатора страсть к морским исследованиям объясняется целым рядом причин, главными из которых были следующие.
Во-первых, если мавры в Африке были действительно столь могущественны и многочисленны, как о них говорили в Европе, принцу, «как любому разумному человеку, обладающему естественной предусмотрительностью» (по выражению португальского историка Азурары), следовало бы выяснить силу врагов Святого Креста и пределы их могущества.
Во-вторых, за 31 год войны с маврами принц Энрике «не нашел ни одного христианского короля или принца за пределами своих земель, который во имя любви к Господу нашему Иисусу Христу согласился бы помочь ему в этой войне. Поэтому он пытался выяснить, не найдется ли в Африке или Индии христианских принцев, в которых любовь к Христу сильна настолько, что они согласились бы помочь ему в борьбе против врагов христианской веры» (в частности, принц Энрике пытался получить информацию о легендарном христианском «царстве пресвитера Иоанна в Индиях» — и со временем португальские мореплаватели действительно установили контакт с изнемогавшей в борьбе с мусульманами христианской Эфиопией, или, как тогда говорили, Абиссинией, едва не ставшей в результате этого контакта колонией Португалии).
В годы правления Энрике Навигатора (в котором стремление к открытию новых земель неразрывно сочеталось с благочестивым стремлением способствовать обращению в христианство закосневших во мраке язычества обитателей этих земель и, тем самым, спасению их душ) Орден Христа занялся активной миссионерской и торговой деятельностью в португальских колониях. Так, в 1425 г. рыцари Христа под знаком красного креста храмовников колонизировали остров Мадейру и Канарские острова, в 1445 г. — Азорские острова, а в дальнейшем исследовали западное побережье Африки.