Троицкий собор с гравюры 1716 г.
Сразу возникла одна трудность – небольшие размеры храма не позволяли проводить масштабные государственные богослужения. Решение нашли быстро, и царь приказал реконструировать первую городскую церковь. В том же году храм расширили, пристроив с северной и южной сторон дополнительные приделы. С западной стороны к старому зданию пристроили большую трапезную, над которой возвели двухъярусную колокольню с открытыми ярусами звона в виде больших арок. Под колокольней находился и главный вход с крыльцом, традиционно прозванным в народе «красным». В праздничные дни на красном крыльце стояли государь и придворные, а также отсюда оглашались важные правительственные указы.
В итоге храм получил форму креста и колокольню с высоким «голландским» шпилем. Отдельных изображений собора начала XVIII века не осталось, но на некоторых гравюрах можно хорошо рассмотреть его в общей панораме города.
Из Москвы привезли куранты, снятые с Сухаревой башни, и каждый час над Петербургом разносились звуки мелодии «Господи, помилуй». Второй достопримечательностью обновлённого Троицкого собора стал большой шведский трофейный колокол из города Або.
В те годы район вокруг храма, получивший позднее название Троицкой площади, считался центральным в городе – здесь располагались правительственные здания, Сенат, двухэтажный Гостиный двор с таможней. Тут же, на площади, заседал Синод, находились оружейный двор и синодальная типография. По приказу царя здесь поставили высокий обелиск, вокруг которого устраивались разного рода увеселительные мероприятия. Так что площадь служила и местом развлечения немногочисленных пока горожан.
Знаменитый государственный деятель петровской эпохи Феофан Прокопович в «Истории Петра Великого» в 1713 г. писал: «…здесь на превеликой площади церковь, во имя Святые Троицы, построена, деревянная… и многое народу число вмещающая; в сем храме Государственные совершаются молебны и благодарения, и в сем же кавалерия святого апостола Андрея, храбрым мужам празднественно даете…».
Собор нередко становился местом официальных торжеств, в частности, в храме проходило награждение высшей наградой Российского государства – орденом Святого Андрея. В Троицкой церкви отмечали Полтавскую победу и Ништадтский мир. Здесь служили торжественный молебен по случаю возвращения Петра из-за границы. В Троицком соборе Петра I официально провозгласили первым российским императором.
Каждое воскресенье царь с семьей присутствовал на службе.
После смерти первого императора и императрица Екатерина I, и император Пётр II, и императрица Анна Иоанновна приносили присягу в Троицком соборе. В храме торжественно отмечали восшествие на престол очередного монарха.
Учитывая значимость Троицкого собора, власти решают в 1732 г. возвести его в камне, заменив деревянную недолговечную постройку. Петербургские архитекторы М.Г. Земцов и П.М. Еропкин составляют проекты нового собора, но каменного храма на Троицкой площади так и не появилось. А деревянный храм оставался действующим всю первую половину XVIII в.
Со временем собор начинают преследовать несчастья. В 1742 г. власти решили полностью разобрать пришедшее в ветхость здание и построить на его месте новое. По указанию императрицы Елизаветы Петровны новый деревянный собор должен был полностью соответствовать старому, построенноному при её отце.
Строительные работы по восстановлению собора вели И.И. Сляднев и Х. фан Болес, и через три года деревянное здание церкви было полностью готово. Некоторые иконы для иконостаса написали художники М.Л. Колокольников и И.Я. Вишняков, хотя бόльшая часть образов перешла в новый собор из старой церкви.
Летом 1745 г. в торжественной обстановке освятили придел Преподобного Харитона, через год, в присутствии её величества императрицы Елизаветы Петровны, прошло освящение и главного престола в честь Святой Троицы.
В 1750 г. страшный пожар полностью уничтожил деревянную постройку. Погибли древний иконостас с иконами, все колокола и знаменитые куранты. И вновь императрица Елизавета Петровна решает возобновить церковь, что и было сделано к 1756 г. На этот раз идут иным путём – на Троицкой площади решают установить деревянный храм, с 1725 г. стоявший на месте третьего Летнего дворца. Храм, разобранный ранее, перевозят на Троицкую площадь и собирают под руководством архитектора С.А. Волкова.
Этот второй по счёту храм не имел ничего общего с первоначальным ни в архитектуре, ни в своём убранстве. Здание состояло из центрального объёма с одним куполом и пристроенной к нему двухъярусной колокольней, в которой располагался главный вход в храм. Фасады церкви украсили немногочисленными колоннами и пилястрами, и хотя архитектурной достопримечательностью храм не стал, тем не менее все последующие годы он был важным духовным центром столицы, хранившим некоторые святыни, связанные с именем основателя Петербурга.
В Троицком соборе перед иконой святого Апостола Петра находилось паникадило из слоновой кости о семи рожках, выточенное самим царём Петром I. На это указывала памятная надпись, выбитая на металлическом ободке: «паникадило сие работы и трудов государя императора Петра Великого». На аналое у иконы Святой Троицы располагался укрытый стеклом небольшой образ Благовещения Пресвятой Богородицы, высеченный из мрамора. Последней царской реликвией из числа хранившихся в Троицком соборе стала небольшая круглая коробочка из слоновой кости для ладана.
Кроме вещей, прямо связанных с Петром I, в храме бережно сохраняли множество предметов первой четверти XVIII столетия. Молдавский господарь Кантемир завещал храму знамя из зелёного шелка с изображением Божией Матери и ангелов, а также крест из пальмового дерева работы афонских монахов с виртуозной резьбой сцен из Священного Писания. Это знамя, свидетель Азовских походов, поместили в большую позолоченную рамку и вывесили справа от входа в храм. Памятная табличка сообщала: «знамя, бывшее в войсках государя императора Петра I во время Азовских походов».
В июне 1756 г. храм освятили, и по этому случаю императрица Елизавета Петровна подарила туда шитую золотом бархатную сень.
Из храмовых икон особым почитанием пользовался образ Греческой, или Андрониковой, Богоматери, появившийся в России в 1821 г. По преданию, не подтверждённому историческими документами, эта икона размером 33 × 24 сантиметра написана евангелистом Лукой и долгое время находилась в греческом монастыре города Монемвасия. После разрушения этой обители турками Богоматерь вывезли в нашу страну, и с 1868 г. она выставлялась в Троицком соборе слева от алтаря, на специальном мраморном пьедестале.
Троицкий собор неоднократно ремонтировали. В 1802–1805 гг. архитектор Л. Руска капитально перестраивал историческое здание. В 1824 г., после наводнения, архитектор П.С. Филиппов руководил срочными ремонтными работами. В 1875–1876 гг. под руководством архитектора Е.Е. Аникина укрепляли фундаменты храма и обновляли интерьеры церкви. Живописные работы внутри храма провел художник А.Е. Бейдеман.
