Окончив начальную школу, Антанас, успешно сдав вступительные экзамены, поступил учиться в Мариампольскую мужскую гимназию, в которой уже учился его старший брат. Гимназия была классического профиля. В ней преподавали русский язык и литературу, литовский, немецкий, латинский и греческий языки, закон Божий, арифметику, алгебру, геометрию, физику, космографию, всеобщую, российскую и польскую историю и географию, природоведение. Кроме того, преподавались рисование, гимнастика и музыка. Преподавание также велось на русском языке. Антанас отдавал предпочтение точным наукам, но и по другим предметам считался лучшим учеником в классе.
В свободное время любил играть в шахматы, читать, играть на мандолине и заниматься спортом. Все учащиеся жили при гимназии.
Начавшаяся в 1914 году Первая мировая война изменила привычный уклад жизни Сувалкской губернии. Жителям прифронтовой полосы было приказано оставить свое хозяйство и отступить на 16 км от линии фронта. В 1915 году, с началом немецкого наступления на Восточном фронте, началась эвакуация в глубь России промышленных предприятий и государственных учреждений, а позже и учебных заведений. Мариампольская гимназия сначала была эвакуирована в Вильну, а позднее в Ярославль. Получив по 10 рублей проездных, вслед за гимназией уезжали и гимназисты. Попечительством учащихся занимались «Комитет Ея Императорского Высочества Великой Княжны Татианы Николаевны для оказания временной помощи пострадавшим от военных бедствий» и «Литовское общество помощи пострадавшим от войны» Мартинаса Ичаса. 28 мая 1916 года в Ярославле Антанас Густайтис окончил гимназию со средним балом 4,76 по пятибалльной системе.
Подав заявление и успешно сдав вступительные экзамены, в сентябре 1916 года Густайтис поступает учиться в петроградский Институт инженеров путей сообщения Императора Александра I. Окончив первый курс обучения, он должен был быть сразу же переведен на второй, но в 1917 году в России была объявлена мобилизация студентов 1898 года рождения в Российскую армию. Поняв, что может быть отправлен на фронт, Густайтис подает заявления о приеме в одесское Сергеевское артиллерийское училище, а позднее и в петроградское Константиновское артиллерийское училище. После октябрьского переворота 1917 года он наконец возвращается в Литву.
Выпускник Военного авиационного училища в Каунасе лейтенант Антанас Густайтис. 1919 г.
16 февраля 1918 года Литва провозгласила свою независимость как Литовская Республика. Теперь эту независимость предстояло отстоять с оружием в руках. Из добровольцев началось формирование Войска литовского – вооруженных сил независимой Литвы. 15 марта 1919 года Антанас Густайтис записался добровольцем в Войско литовское и, изъявив желание стать военным летчиком, был направлен в недавно созданное Военное авиационное училище в Каунасе, где тогда преподавали немецкие инструкторы – летчики Первой мировой войны. 16 декабря 1919 года он окончил училище с первым выпуском из 34 летчиков с присвоением воинского звания лейтенанта инженерии и направлен в авиационную часть.
18 января 1920 года был назначен помощником командира учебного взвода, а 16 апреля того же года приступил к учебным полетам в составе 1-й воздушной эскадрильи ВВС Литвы в качестве курсанта-летчика.
С 1918 по 1920 год Литва вела боевые действия на трех фронтах. Ее противниками были Советская Россия, желавшая насильственно установить в Литве советскую власть, Польская Республика, стремившаяся к восстановлению государства «от моря до моря», неотъемлемой частью которого должна была быть и Литва, и Русская Западная добровольческая армия генерала П. Бермондта-Авалова, намеревавшаяся установить собственную власть в Прибалтике. Набирала свои обороты и воздушная война. С 18 июля по 21 ноября 1920 года курсант-летчик Антанас Густайтис участвует в боевых действиях на польском фронте, совершает боевые вылеты, проводя воздушную разведку и бомбардировку позиций противника.
Польско-литовская война 1920 года завершилась победой Польши. Намного превосходя Литву в живой силе и технике, имея больше материальных ресурсов и получая специальную помощь от стран Антанты, особенно Франции, Войско польское практически полностью выполнило все поставленные перед ним задачи по занятию Виленского края и включению его в состав Польши.
1 марта 1921 года Антанас Густайтис направлен во 2-ю воздушную эскадрилью на должность военного летчика, а 4 июля 1922 года, после окончания курсов высшего пилотажа, ему присваивается звание военного летчика с направлением для прохождения дальнейшей службы в 1-ю воздушную эскадрилью. 30 марта 1923 года ему присваивается воинское звание старшего лейтенанта.
С 1925 года начинается карьера Густайтиса как авиаконструктора. Любительская попытка сконструировать летательный аппарат увенчивается успехом. 14 июля 1925 года с Каунасского аэродрома он поднимает свой самолет в воздух, а позднее совершает на нем полет в родную деревню навестить родителей и приземляется на лугу у отчего дома. Самолет оказался надежным и позднее был приобретен управлением ВВС Литвы для нужд литовской военной авиации, где использовался в качестве учебного до 1930 года, а в 1935 году передан Военному музею Литвы, где хранится и в настоящее время. Вслед за успехом своей первой конструкции 22 сентября 1925 года Антанас Густайтис направляется на учебу во Францию, в Парижскую Высшую школу воздухоплавания и механических конструкций.
10 ноября 1927 года поднимает в воздух второй самолет своей конструкции – ANBO-II. Спроектированный как учебный, этот самолет был экономичнее использовавшихся в то время в ВВС Литвы немецких самолетов времен Первой мировой войны и, хотя и имел менее мощный двигатель, но превосходил их в скорости и маневренности. Самолет использовался в военной авиации до 1931 года, после чего был реконструирован и передан аэроклубу. 26 августа 1934 года, совершая акробатический полет, самолет разбился, летчик погиб.
23 июля 1928 года завершает обучение во Франции и становится дипломированным инженером авиации и механических конструкций.
Командир перелета вокруг Европы полковник-лейтенант Антанас Густайтис (слева) у самолета ANBO-IV с генеральным консулом Литвы в Копенгагене Bjarne Nielsen (в центре) и начальником военной авиации Дании полковником Förster (справа). Копенгаген. 27 июня 1934 г. (Dansk Presse Фото из LCVA, Р-00898)
Получив диплом инженера, Густайтис уже профессионально продолжает конструкторскую деятельность. В августе 1929 года свой первый полет совершает его новый самолет ANBO-III, которому будет суждено стать первым литовским серийным самолетом. Кроме прототипа, в Мастерских военной авиации с 1930 по 1931 год были построены две серии по 4 самолета. В ВВС Литвы самолет применялся в качестве учебного, разведывательного, а также для буксировки воздушных мишеней.