Деятельность Комитета, возглавляемого Путиным, уже тогда вызвала вопросы у депутатов Петросовета. Уже 10 января 1992 года по решению 13-й сессии Петросовета была создана депутатская рабочая группа по расследованию деятельности КВС. Группу возглавили депутат Марина Салье, председатель Комитета Петросовета по продовольствию, и депутат Юрий Гладков. Вот что установила рабочая группа:
Сырье, в том числе и редкоземельные металлы, продавались с разрешения КВС за границу «по демпинговым ценам, на порядок ниже рыночных». В частности, в договоре КВС с российско-германским СП «Джикол» (основной акционер, некто Питер Бахман, получил лицензию на вывоз 13 997 кг редких металлов) цена на 1 кг скандия установилась в 72,6 немецких марки, тогда как цена скандия на мировом рынке в две тысячи раз выше — 150 тысяч немецких марок. Цены на другие редкие металлы были занижены в 7, 10 или 20 раз. Путин, впрочем, осторожно этот договор не подписывал, он подписан одним из его заместителей.
В договорах КВС для фирм предусматривались комиссионные. В договоре от 3 января 1992 года с МП «ЛОКК», подписанном лично Путиным, комиссионные составляли 25 % (540 тысяч долларов). В договоре с «Интерлесбиржей», заключенном «в лице председателя Комитета Путина В. В.» и подписанном Аникиным, комиссионные составляли 50 % (5 983 900 долларов). В договоре КВС с МО «Святослав» комиссионные за реализацию 20 тысяч тонн хлопка также составляли 50 % (12 миллионов долларов).
В заключении рабочей группы Салье приводились также случаи выдачи лицензии на вывоз сырья под заведомо фиктивные поставки продовольствия (поскольку продукты в город не поступили). Часть договоров заключалась с такими огромными формальными нарушениями, которые сделали договора юридически бессильными, и, таким образом, добиться от фирм их исполнения, — то есть реальной поставки продовольствия, — по суду было невозможно.
Рабочая группа Салье рекомендовала Собчаку отстранить Путина от занимаемой должности и передала материалы своего расследования в городскую прокуратуру и в Контрольное Управление Администрации президента РФ. (О результатах расследования был официально извещен также председатель КВЭС Петр Авен.) Руководитель Контрольного Управления Юрий Болдырев 31 марта 1992 года наложил на докладную рабочей группы такую резолюцию: «В Управление поступили материалы от депутатов Городского Совета Санкт-Петербурга, свидетельствующие о необходимости отстранения от занимаемой должности председателя Комитета по внешним связям города Владимира Владимировича Путина. Прошу не рассматривать вопрос о его назначении на любую другую должность до принятия Управлением решения по данному вопросу».
Прокурор города Владимир Ерёменко направил Собчаку представление о «некорректно составленных договорах КВС и неверном оформлении некоторых лицензий». Председатель КВЭС Авен не стал опротестовывать лицензии, выданные петербургским КВС. Возможно, именно этим эпизодом объясняются отличные отношения президента Путина с финансовой группой «Альфа», возглавляемой Петром Авеном. Собчак не разрешил отстранить Путина. Тем не менее, заместитель Путина Аникин вынужден был уйти в отставку. А часть заключенных сделок были расторгнуты. По данным "Новой Газеты" фирмы, получившие от Путина лицензии на торговлю сырьем, всего получили 34 миллиона долларов комиссионных ("Новая Газета" от 13–19 марта 2000 г.).
В 1992 году В. В. Путин был назначен заместителем мэра с сохранением поста председателя КВС. То есть был повышен в должности, а не отстранен. И за ним сохранили руководство прибыльным бизнесом: Комитетом внешних связей мэрии. В те годы Путин получил прозвище Серый Кардинал. Он консультировал Собчака по всем «внешним» вопросам, был его очень близким доверенным лицом. Все серьезные документы визировались сначала Путиным, а только затем Собчаком.
С 1993 года Собчак начинает вести «международный» образ жизни и часто отлучается за рубеж. В его отсутствие именно Путин исполняет обязанности мэра. Круг его компетентности был необычайно широк — дипломатические представительства, гостиницы, игорный бизнес, общественные объединения, кураторство над силовыми структурами и взаимодействие с армией, МВД, ФСК, прокуратурой, таможней. Путин также занимался всеми крупными инвестиционными проектами. В марте 1994 года он был назначен первым заместителем председателя городского правительства. И все же он сохраняет пост председателя Комитета внешних связей. Как медом, видимо, этот Комитет был намазан.
Петербургский период жизни Путина полон скандалов, в которые он попадал, но откуда выходил сухим. Одним из самых интересных, на мой взгляд, был эпизод, когда в 1991 году по просьбе Собчака и Путина руководство московской милиции провело несанкционированный обыск у бывшего помощника Собчака Юрия Шутова с целью изъятия магнитофонной записи разговора Собчака с резидентом французской разведки. В 1992 году на Шутова, автора книги "Собчачье сердце" было совершено покушение, однако связать этот инцидент с именами Собчака или Путина никто не рискнул. С приходом к власти Владимира Владимировича Шутов был арестован и обвинен во множестве преступлений, в том числе чуть ли ни во всех заказных убийствах в городе Санкт-Петербурге, и вот уже шесть лет находится за решеткой. По данным газеты «Версия» (17–23 августа 1999 года) материалы по несанкционированному обыску у Шутова в 1991 году хранятся (или, по крайней мере, хранились) у старшего следователя Управления по особо важным делам Генпрокуратуры РФ Ю. М. Ванюшина. Резидент французской разведки говорил с Собчаком, по-видимому, о таких делах, что Шутова даже в суд боятся вывозить. Он так и сидит, несудимый, Железная Маска.
Недовольных первым заместителем Собчака было множество. Конкретные нарекания вызвали следующие направления деятельности Путина:
1). Привлечение к сотрудничеству иностранцев, как подозревали, — небескорыстное;
2). Нарушения в ходе приватизации крупных объектов муниципальной собственности;
3). Незаконная торговля с использованием служебного положения и иные злоупотребления;
4). Исполнение конфиденциальных поручений Анатолия Собчака.
По первому пункту. Путин способствовал приходу в город ряда крупных немецких фирм и банков. В частности, при его содействии был открыт филиал BNP-Drezdner Bank (Rossija). (Связь Путина с Dresdner Bank продолжается и поныне. Глава русского отделения банка Маттиас Ворниг вошел в Совет директоров «Газпрома» в феврале. Ворниг, согласно газете "Wall Street Journal" до 1989 года был майором «Штази», и сотрудничал и дружил тогда с майором Путиным. Продолжает дружить до сих пор, чем и объясняется его великолепная карьера в России.) Путин помог банку разместиться в здании бывшего германского посольства на Исакиевской площади. Он также помог банку "Лионский кредит" (Credit Lionnes) получить особняк на Невском проспекте. Офис компании Coca-Cola был размещен в здании Дома Политпросвещения Ленинградского Обкома КПСС. Саму компанию даже освободили за какие-то заслуги от местных налогов. Компании Proctor-and-Gamble и Gillet также пользовались покровительством будущего президента.
По второму пункту обвинений. По данным газеты «Коммерсант» (1999 г., № 32) Путин принимал участие в продаже гостиницы «Астория». Дело в том, что в Санкт-Петербурге был проведен тендер по продаже 40 % пакета акций этой гостиницы, и Путин, якобы, пытался увеличить свой пакет за счет покупки, которая ему, в конце концов, не удалась. Акции достались владельцу завода по производству спиртных напитков "А.Ф.Б.-2" А. Сабадашу. В ответ Путин, якобы, (по данным газеты «Стрингер», ноябрь 2000 г.) пригрозил, что разгромит завод, но к концу 1998 года конфликт, наконец, был улажен, и Путину, опять-таки по данным газеты, были выплачены «отступные» — 800 тысяч долларов США. Путин еще несколько раз поучаствовал в гостиничном бизнесе: привел иностранцев в гостиницы «Европа» и "Невский Палас".
