Руководство.
Секретариат.
Оперативное отделение.
Следственная часть.
1-й отдел (Генеральный штаб, штабы фронтов, армий, разведуправление).
2-й отдел (ВВС, ПВО, ВДВ).
3-й отдел (танковые войска, артиллерия).
4-й отдел (по руководству работой особых органов фронтов по родам войск).
5-й отдел (службы тыла).
6-й отдел (войска НКВД).
7-й отдел (оперативный учет).
8-й отдел (шифровальный).
Административно-хозяйственно-финансовое отделение.
В январе 1942 года в состав УОО НКВД вошла контр разведка флота. Был создан 9-й отдел (ВМФ). А в июне того же года к уже существующим девяти отделам добавилось три новых:
10-й отдел (по руководству контрразведывательной работой особых органов фронтов и округов);
11-й отдел (инженерные и химические войска, саперные армии, оборонительного строительства и войска связи);
12-й отдел (Главное управление формирований и комплектования Красной Армии).
На 30 июня 1942 года расстановка начальствующего состава и структура Управления особых отделов выглядела так:
Руководство (В. С. Абакумов, С. Р. Мильштейн, Ф. Я. Тутушкин, Н. А. Осетров, Л. Ф. Цанава).
Секретариат (Я. М. Броверман).
Оперативное отделение (А. В. Миусов).
Следственная часть (Б. С. Павловский) в составе трех отделений:
1-е отделение – по шпионажу;
2-е отделение – по антисоветским формированиям;
3-е отделение – по руководству следственной работой на периферии.
1-й отдел (И. И. Москаленко) в составе трех отделений:
1-е отделение – по оперативному управлению Генерального штаба, штабам фронтов и армий;
2-е отделение – по всем другим управлениям и отделам Генштаба;
3-е отделение – по Главному разведывательному управлению Генштаба, разведорганам фронтов и армий.
2-й отдел (А. А. Авсеевич) в составе пяти отделений:
1-е отделение – по штабу ВВС;
2-е отделение – по вооружению и тылу ВВС;
3-е отделение – по Академии ВВС и периферийным частям ВВС;
4-е отделение – по ПВО;
5-е отделение – по ВДВ.
3-й отдел (В. П. Рогов) в составе трех отделений:
1-е отделение – по Главному автобронетанковому управлению Красной Армии, управлениям фронтов, армий, танковых армий, корпусов и бригад;
2-е отделение – по артиллерийским управлениям фронтов, артотделов армий, артиллерии Резерва Верховного Главнокомандования, Управлению Гвардейских минометных частей, гвардейским минометным частям;
3-е отделение – по Главному артиллерийскому управлению Красной Армии.
4-й отдел (Г. С. Балясный-Болотин) в составе четырех отделений:
1-е отделение – по руководству агентурно-оперативной работой особых органов (по родам войск) на Карельском, Ленинградском, Волховском, Северо-Западном, Калининском фронтах, в 7-й отдельной армии
[28]
, резервных армиях;
2-е отделение – по руководству агентурно-оперативной работой особых органов (по родам войск) на Западном, Брянском
[29]
, Юго-Западном, Южном, Северо-Кавказском
[30]
фронтах;
3-е отделение – по борьбе с изменой, дезертирством, самострелами, организации заградительной службы;
4-е отделение – по редакциям военных газет, органам военной прокуратуры, военным трибуналам, военным академиям, Центральному дому Красной Армии.
5-й отдел (К. П. Прохоренко
[31]
) в составе двух отделений:
