Большинство резидентур были выведены из городов, где гитлеровцы насаждали мощную осведомительскую сеть и имели многочисленные карательные органы, и стали действовать с оперативных баз, сосредоточенных в лесных и горных массивах. Наряду с этим было усилено их контрразведывательное обеспечение. В состав РДР, как правило, включался кадровый контрразведчик, занимавшийся поиском и выявлением вражеской агентуры.
Самое серьезное внимание было уделено профессиональной подготовке руководителей резидентур и командиров оперативно‑боевых групп. В этих целях на базе отдельной мотострелковой бригады особого назначения (ОМСБОН), ядро которой составляли опытные работники органов госбезопасности, испытанные бойцы из испанских интербригад и многие известные советские спортсмены, была организована всесторонняя подготовка кадров разведчиков, диверсантов и боевиков. В отдельные периоды численность этой сверхэлитной части достигала пяти тысяч человек. В ее учебном центре прошли подготовку около двух тысяч иностранцев.
Последующие результаты оперативно‑боевой деятельности резидентур и боевых групп подтвердили правильность такого подхода руководства Особой группы. В дальнейшем ни одна из них не подверглась разгрому, а ее резиденты были недосягаемы для гитлеровских спецслужб. Возросший профессиональный уровень командиров и бойцов способствовал существенному повышению эффективности разведывательной и диверсионной деятельности РДР.
Но все это было впереди, а пока танковые клещи вермахта стремительно тянулись к Москве. К началу октября 1941 года группа армий «Центр» захватила города Орел, Брянск и Мценск. В результате значительная часть соединений Западного, Резервного и Брянского фронтов оказалась в окружении. Сплошной линии обороны не существовало, резервов для быстрого закрытия бреши в обороне командующие фронтов не имели. Возникла непосредственная угроза столице, и 12 октября Государственный комитет обороны (ГКО) своим постановлением «Об охране Московской зоны» предписал НКВД СССР «навести жесткий порядок на тыловых участках фронта, прилегающих к территории Москвы с юга и запада, по линии Калинин — Ржевск — Можайск — Тула — Коломна — Кашира».
Начальником охраны Московской зоны был назначен заместитель наркома внутренних дел СССР, комиссар государственной безопасности 3‑го ранга И. Серов. При НКВД СССР начал функционировать штаб охраны Московской зоны, ему в оперативное подчинение перешли внутренние войска численностью около шести тысяч человек, милиция, рай— и горотделы НКВД, истребительные батальоны и заградительные отряды. Реорганизация затронула и Особую группу при наркоме НКВД СССР. С учетом возрастания значимости разведывательно‑диверсионной деятельности, она была преобразована во 2‑й отдел НКВД СССР. Эти изменения в незначительной степени затронули управленческий аппарат и в основном коснулись резидентур. Резко возросли их количество и качество технического оснащения.
Тем временем обстановка на фронте с каждым днем все более накалялась. На северо‑западе гитлеровцы силами 9‑й армии и 3‑й танковой группы 14 октября захватили город Калинин. На юго‑западе после пяти суток ожесточенных боев они ворвались в Малоярославец. В этот же день, 18 октября, на самом опасном — западном направлении под ударами 4‑й танковой группы пал Можайск. В связи с этим 19 октября ГКО объявил о переводе Москвы и прилегающих к ней районов на осадное положение. Речь уже шла о том, устоит столица или нет перед натиском фашистов. В наркоматах и других государственных учреждениях, в том числе и НКВД, началась массовая эвакуация. В то же время управление охраной Московской зоны продолжало осуществляться центральным аппаратом наркома внутренних дел непосредственно из здания на Лубянке и одновременно дублировалось из запасного командного пункта в районе Останкино.
В этот очень драматичный период войны, когда решалась судьба Москвы, на Особую группу — 2‑й отдел помимо задачи проведения разведывательно‑диверсионных операций в тылу противника была возложена еще одна специальная миссия. В ГКО не исключали вероятности прорыва в столицу гитлеровских войск, в связи с чем подразделениям НКВД, и в первую очередь подчиненным П. Судоплатова, была поставлена задача по противодействию спецотрядам противника, целью которых являлся захват важнейших объектов. Один из таких отрядов под кодовым названием «Москва», возглавляемый начальником 7‑го управления РСХА штандартенфюрером Зиксом, двигался с передовыми частями 4‑й танковой армии. По замыслу руководства НКВД, ему должны были противостоять бойцы ОМСБОНа. Линия обороны, которую им предстояло занять, начиналась у Охотного Ряда и заканчивалась у Белорусского вокзала. Но Зиксу и его подчиненным не суждено было увидеть кремлевские стены: на дальних подступах к ним, близ Шереметьево, у моста через Москву‑реку, ударная моторизованная группа из отряда «Москва» была остановлена и разгромлена бойцами ОМСБОНа.
Наряду с ним на случай захвата столицы заблаговременно, с сентября, Особой группой — 2‑м отделом, 3‑м секретно‑политическим управлением (начальник Н. Горлинский) и транспортным управлением (начальник Н. Синегубов) НКВД была начата подготовка групп сопротивления и подполья для осуществления боевой, разведывательной и диверсионной деятельности.
Помимо самого Павла Анатольевича, его заместителей Н. Эйтингона и В. Какучая активную работу в этом направлении вели начальники отделений В. Дроздов, М. Маклярский, П. Масся и другие. Несмотря на жесточайший лимит времени и все более осложняющуюся обстановку на фронте, они подошли к выполнению поставленной задачи творчески, а главное — с безусловным доверием к тем, кому предстояло лицом к лицу сражаться с врагом.
В числе руководителей групп агентов‑боевиков, агентов‑диверсантов и разведчиков оказались не только кадровые сотрудники органов государственной безопасности, но и люди совершенно мирных и даже экзотических профессий. Среди них были известные артисты и международные аферисты, бывшие царские офицеры, в прошлом крупные коммерсанты и даже осведомители царской охранки, коммунисты, эсеры и анархисты. В частности, одним из них был известный композитор Л. Книппер, двоюродный брат Ольги Чеховой, близкой к высшим руководителям Германии. Ему предстояло со своей группой, при благоприятно складывающейся ситуации, ликвидировать Гитлера. Другой кандидат на должность резидента группы «Иван» — Н. Жиделев в свое время работал с Ф. Дзержинским и являлся членом Коллегии и Президиума ВЧК. Его резидентуре предстояло осуществить ряд крупных диверсий. Выпускница Военной академии им. Фрунзе, участница войны в Испании старший лейтенант Е. Паршина возглавила группу «Ветров».
При всей разнице в политических взглядах и социальном положении их объединяло одно общее — они любили Родину больше, чем самих себя. Для них это слово не было пустым звуком, каждый делом доказал свою надежность и преданность новым идеалам. Кроме того, по замыслу Павла Анатольевича и других руководителей НКВД, ответственных за выполнение «Московского плана», все отобранные кандидаты своими оперативными возможностями должны были заинтересовать гитлеровские спецслужбы и тем самым расширить разведывательные возможности резидентур.