Деникин, ориентировавшийся на Антанту, закрывал глаза на прогерманскую позицию Краснова, поскольку получал от Донской армии вооружение и продовольствие.
После вступления на Украину германских войск оттуда в Россию отступил формировавшийся еще царским правительством корпус из чехословацких военнопленных (около 45 тысяч человек). Совнарком 26 марта 1918 года разрешил его эвакуацию через Дальний Восток во Францию при условии сдачи основной массы оружия в специально назначенных пунктах. К середине мая чехословацкие эшелоны растянулись по железной дороге от Пензы до Владивостока. Среди бойцов и командования корпуса сильны были ненависть к Австро-Венгрии (на родине их ждал суд за вступление в ряды неприятельской армии) и сочувствие социалистам-оборонцам, входившим в свергнутое большевиками Временное правительство (в корпусе сильны были чешские социал-демократы). Между тем Владивосток был оккупирован японскими войсками. Большевики вели также переговоры с державами Антанты о предоставлении чехословакам судов в Мурманске и Архангельске.
Движение эшелонов к Владивостоку застопорилось. Еще 2 мая Верховный совет Антанты принял решение попытаться использовать чехословацкий корпус для создания нового Восточного фронта против австро-германских войск, а при необходимости и против большевиков. Глава военного ведомства Троцкий отдал приказ о разоружении корпуса. 20 мая командование и политическое руководство корпуса – Чехословацкий национальный совет – приняли решение оружие не сдавать. Попытка разоружить корпус вызвала восстание: чехословацкие солдаты опасались, что безоружными их сразу же выдадут центральным державам. Малочисленные красноармейские отряды и гарнизоны были легко разгромлены хорошо организованными и обученными частями корпуса.
25 мая выступили эшелоны в Сибири, где их возглавил генерал Р. Гайда. 26 мая восстали чехословацкие части на Урале под командованием генерала С. Войцеховского, а восстание в Поволжье 28 мая возглавил генерал С. Чечек. В течение июня и июля чехословацкие войска совместно с эсеровскими отрядами очистили эти регионы от частей Красной армии.
10 июля командующий советским Восточным фронтом бывший подполковник левый эсер Михаил Муравьев, узнав об аресте в Москве руководителей своей партии, в Симбирске объявил себя главнокомандующим армии, действующей против Германии, телеграфировал в Совнарком и германское посольство об объявлении войны Германии и приказал своим войскам продвигаться совместно с чехословацким корпусом к Волге и далее на Запад для отпора немцам. Последствий это не имело, так как на следующий день Муравьев был застрелен большевиками на заседании местного Совета.
8 июня в Самаре после занятия города чехами вышел из подполья Комитет членов Учредительного собрания (Комуч) во главе с эсером В. Вольским, объявивший себя «временной властью» в Самарской губернии и других территориях, освобождаемых от большевиков. Комуч стал формировать собственную Народную армию из недовольных Советами рабочих, крестьян, студентов и офицеров. Одновременно он пытался обеспечить соблюдение основных демократических свобод и осуществление программных целей социалистических партий, вроде 8-часового рабочего дня.
Первоначально Народная армия благодаря чехословацким частям достигла значительных успехов, 6 августа захватив Казань, где в качестве добычи ей досталась эвакуированная сюда часть золотого запаса России. Однако постепенно укреплялась дисциплина в Красной армии и увеличивалась ее численность. Чехословаки же не горели особым желанием воевать в России и с ростом сопротивления со стороны красных предпочитали воздерживаться от активного участия в боях. Чехословацкие эшелоны перемещались с Поволжья и Урала в Сибирь. Народная же армия демократического Комуча многими чертами напоминала русскую армию в эпоху Временного правительства. Многие части были недисциплинированны, офицеры там не пользовались авторитетом и до осени 1918 года не носили погон. Наиболее боеспособными частями были полки ижевских и воткинских рабочих, в августе 1918 года восставших против большевиков, а после подавления восстания прорвавшихся на соединение с Народной армией.
В сентябре войска Комуча потерпели ряд поражений. 10 сентября красные заняли Казань, 29-го – Симбирск. Среди офицеров все настойчивее раздавались требования военной диктатуры. 23 сентября для руководства всеми антисоветскими силами на Востоке была создана Уфимская директория во главе с эсером Н. Авксентьевым. Комуч отказался от претензий на верховную власть и стал называться Съездом членов Учредительного собрания.
Вступление Красной армии в Казань в 1918 г.
В октябре Директория перебралась в Омск. Здесь 18 ноября ее при поддержке офицеров и казаков сверг адмирал Александр Колчак. Авксентьев и часть членов Директории были высланы за границу. Другие были арестованы и после неудачного восстания омских рабочих против Колчака расстреляны. Ряд бывших членов Комуча, включая Вольского, уйдя в подполье, приняли решение прекратить вооруженную борьбу с советской властью.
2 августа 1918 года советская власть была свергнута на Севере России при поддержке англо-французских войск, высадившихся в Мурманске и Архангельске будто бы для защиты этих портов от германской угрозы и предотвращения скопившихся там военных материалов центральными державами. К власти здесь пришло правительство Северной области во главе с известным эсером Николаем Чайковским. Здесь численность войск интервентов, преимущественно английских, составляла около 25 тысяч человек. Численность русских антибольшевистских сил была в несколько раз меньше. Английское командование не предпринимало широкомасштабных наступательных действий, ограничиваясь попытками продвинуться навстречу чехословацким частям, наступающим с востока.
Официально красный террор был объявлен большевистским Совнаркомом постановлением от 5 сентября 1918 года после убийства 30 августа в Петрограде главы местной ЧК М. Урицкого студентом Л. Каннегиссером и неудавшегося покушения в тот же день в Москве на жизнь Ленина, совершенного профессиональной революционеркой Ф. Каплан. Оба покушавшихся, хотя и принадлежали к эсерам, действовали в одиночку, а не от лица партии. В ответ ЧК объявила, что впредь за покушения на представителей советской власти будут расстреливаться заложники из зажиточных классов населения, офицеров, интеллигенции и всех, заподозренных в контрреволюционной деятельности. Только в Петрограде после выстрелов в Урицкого и Ленина казнили 500 заложников.
В действительности красный террор был развернут гораздо раньше, по крайней мере, с начала 1918 года. Уже в январе этого года Совнарком объявил о создании «трудовых батальонов» из «буржуазии». Сопротивляющихся мобилизации в эти батальоны, равно как и «контрреволюционных агитаторов», предписывалось расстреливать на месте. В июне 1918 года Ленин требует «поощрять энергию и массовидность террора». А Троцкий провозглашал: «Устрашение является могущественным средством политики, и надо быть лицемерным ханжой, чтобы этого не понимать». 17 июля 1918 года по решению Ленина и Свердлова была расстреляна царская семья вместе с оставшимися верными ей слугами. Расстреливали крестьян, не желающих отдавать хлеб продотрядам или просто взятых в заложники за действия тех, кто восставал против советской власти. Расстреливали бывших фабрикантов, банкиров, помещиков, депутатов Думы, офицеров… Лишь незначительная часть жертв красного террора действительно участвовала в контрреволюционных заговорах и в той или иной форме вела борьбу против советской власти.