С постройкой Геленджика окрестные горцы переселились в более отдаленные места и приняли крайне враждебное положение по отношению к русским, по-прежнему не выказывая ни малейшего желания к сближению с ними и запрещая что-либо поставлять в укрепление под угрозой жестокого наказания и разорения провинившихся. Между тем, при занятии Геленджика леса, годного для постройки, не было ближе двух верст от крепости. Окрестности были покрыты кустарником, терном и держидеревом. Сено трудно было добывать. Только в июле солдаты, большей частью под перестрелкой с горцами, успели выкосить, на расстоянии до трех верст около крепости, и сложить внутрь укрепления до 4000 пудов сена; а съестных продуктов совсем неоткуда было достать. Таким образом, солдаты, терпя нужду во всем, плохо справлялись и с работами.
Наконец, в декабре 1832 года Вельяминову было отпущено на постройку Геленджикского укрепления 40 тыс. ассигнациями. На постройку укрепления назначено было 10 рот пехоты и одна артиллерийская Козловского и Нашенбургского полков. Зимой работы были приостановлены до весны. Это было на руку Вельяминову, таившему в глубине души надежду на постройку крепости в Новороссийске, а не в Геленджике.
Вообще Геленджикский отряд не был поставлен в надлежащее положение и в военном отношении. Как видно из рапорта коменданта Геленджикской крепости полковника Чайковского от 23 августа 1832 года, ему, как коменданту, не хотел подчиняться командир Геленджикского отряда судов капитан-лейтенант Аркас, отославший ему назад пакет с приказом о вступлении в должность коменданта нераспечатанным и заявивший, что приказ этот адресован на его имя по ошибке. Чайковский просил командующего войсками Вельяминова установить, в видах единства власти, правильные отношения, при которых он мог бы распорядиться, в случае нападения черкесов на крепость, своевременным обстреливанием судами неприятеля с флангов крепости.
В этом году капитан 2‑го ранга Немчинов распорядился, чтобы до тех пор, пока не будет построено укрепление в Геленджике, в бухте стояли бы два военных брига для прикрытия флангов лагеря, а по окончании постройки одно судно для сношения между Геленджиком и Анапой. Для крейсирования дальше от Геленджика предполагалось назначить также одно судно, которое должно помесячно сменяться стоящими в Геленджиской бухте судами. В октябре 1832 года командир Черноморского флота адмирал Грейг уведомил командира Геленджикского отряда судов, что, согласно воле Государя, для крейсерства вдоль Черноморского побережья назначаются два отряда военных судов – один от Анапы до Гагр, а другой от Гагр до Редут-Кале, и что каждый отряд будет подчиняться местному начальнику сухопутных войск. Таким образом, претензия полковника Чайковского была этим распоряжением устранена, но предварительно и капитан-лейтенант Аркас получил выговор и должное разъяснение относительно нетактичности его поведения. Вообще же командующий отдельным корпусом барон Розен считал необходимым не вызывать никаких столкновений с горцами и обходиться на первое время с ними возможно дружественнее. Он выразил даже порицание полковнику Боровскому, пославшему отряд для фуражировки в окрестности Геленджика, причем пришлось вступить в перестрелку с горцами и потерять в отряде одного убитым и четырех ранеными.
К концу 1833 года Геленджикское укрепление приняло уже характер постоянного селения. Но так как в это время продолжало еще существовать сомнение на счет преимуществ северной стороны бухты перед южной, то барон Розен поручил выяснить этот вопрос генералу Малиновскому, стороннику южной стороны. В декабре 1833 года по поручению Малиновского инженер-полковник Баумер осмотрел вместе с полковником Чайковским «весь бассейн залива» и снабдил подробными наставлениями инженер-поручика Агафоновского о нанесении тригонометрической сети вокруг бухты. В это время вся северная сторона бухты обитаема была еще черкесами, и для снятия ее потребовалось сильное военное прикрытие. Организовавши съемку Геленджикской бухты, инженер Баумер представил следующие соображения барону Розену.
Геленджикское укрепление было расположено в той части бухты, которая изобиловала наиболее богатыми источниками хорошей пресной воды. Офицеры Геленджикского отряда «единогласно уверяли, что на севере бухты в прошлом году водные источники совершенно иссякли». Баумер поручил Агафоновскому проверить этот факт. Ближайшие к крепости сухие и каменистые крутизны, по мнению Баумера, могли иметь вредное влияние на людей в жаркую пору, при уклоне этих мест к полудню. Между тем «долина, занимаемая укреплением, обращена к северо-западу и оказалась здоровой для жительства, а также обитаема была издавна».
На севере бухты пришлось бы вновь перевозить строительные материалы, в случае переноса туда крепости. Там не было также достаточно сенокосов, чтобы можно было прокормить необходимое количество порционного и упряжного скота.
Самое укрепление Геленджик инженер считал достаточно сильным, особенно если привести его в надлежащий вид.
В это время в Геленджике, кроме отряда, находились уже частные лица и заведения. Из рапорта коменданта крепости Чайковского генерал-майору Малиновскому от 12 декабря 1833 года видно, что в Геленджике чрезвычайно размножились вольные продавцы чарочной продажи вина. Таких продавцов Чайковский допустил в Геленджик, чтобы понизить цену на вино у маркитантов, но когда их стало слишком много, он начал выселять их из Геленджика. В 1835 году купец Самойлов просил разрешить ему монопольную продажу вина в Геленджике и Анапе; но генерал Вельяминов отменил распоряжение по этому поводу генерала Малиновского и дозволил торговать вином всем местным жителям.
Несмотря на постоянный приток в Геленджик сторонних жителей, он представлял по внешнему виду довольно невзрачное поселение. Солдаты жили в сырых и холодных землянках; у офицеров жилища были немногим лучше. Не было под рукой ни леса, ни других строительных материалов. В декабре 1833 года полковник Свенховский просил прислать в Геленджик досок на крыши для геледжикских строений, так как земляные крыши пропускали воду и сносились ветрами, а солдаты от сырости и холода сильно болели.
Благодаря такому внешне неустроенному виду Геленджика некоторые из начальствующих лиц продолжали считать его временным укреплением. Как видно из рапорта инженера-полковника Баумера от 15 марта 1834 года, начальник 20-й пехотной дивизии г.-л. Малиновский предполагал перевести крепость в Геленджике с южной стороны на северную. С этой целью снова, уже в третий раз, послан был Баумер осмотреть северную часть бухты. Баумер явился к Малиновскому в Екатеринодар и здесь получил от него указания, как и где следовало избрать новый пункт для крепости, причем Малиновский снабдил его описанием всего берега от Геленджикской бухты до Анапы.
К этому времени, казалось, несколько улучшились и отношения горцев к населению Геленджика. Они перестали делать набеги на крепость, помирившись, по-видимому, с неизбежностью ее существования, но продолжали держать себя в стороне от сношений с русскими. Хоть в это время и был уже открыт в Геленджике меновой двор для торговли с горцами, но последние неохотно посещали его. Так обстояло дело с ближайшими к Геленджику горцами; другие же черкесы смотрели на Геленджик, как на враждебный пункт. Геленджикский комендант полковник Воецкий 23 апреля 1835 года донес генералу Малиновскому, что 12 апреля горцы, которых приняли за едущих на меновой двор, бросились, в количестве 30 чел., на скот, пасшийся у Геленджика, окружили стадо, убили одного рядового и ранили другого. Командующий прикрытием штабс-капитан Кирпотенко не только не дал помощи солдатам, охранявшим стадо, но даже не сделал ни одного выстрела, и горцы беспрепятственно угнали скот. Комендант немедленно послал команду под начальством майора Середина, которая догнала черкесов и отняла часть скота, а остальной скот, в количестве 47 штук, черкесы погнали к Фальшивому Геленджику. В продолжение четырехлетнего существования Геленджика это был первый случай грабежа горцами скота. Черкесский скот, попадавший к русским, последние возвращали черкесам. Соседние горцы воевали с русскими только из-за места, которое русские заняли, и были непричастны к угону скота. Как выяснилось впоследствии, геленджикский скот угнали шапсуги, явившиеся с этой целью к Геленджику из отдаленной местности – окрестностей Екатеринодара.
