Министр иностранных дел статс-секретарь, действительный тайный советник граф Ламсдорф Владимир Николаевич
Наместник на Дальнем Востоке генерал-адъютант, адмирал Алексеев Евгений Иванович
Управляющий Морским министерством генерал-адъютант, вице-адмирал Авелан Фёдор Карлович
Управляющий Министерством финансов тайный советник Коковцов Владимир Николаевич
Морское министерство
Главный начальник флота и морского ведомства: Генерал-адмирал, генерал-адъютант Е.И.В. великий князь Алексей Александрович
Управляющий Морским министерством: генерал-адъютант, вице-адмирал Авелан Фёдор Карлович
Главный морской штаб (ГМШ)
И.д. начальника ГМШ: контр-адмирал свиты Е.И.В. Рожественский Зиновий Петрович
Заведующий Учёным военно-морским отделом, помощник начальника ГМШ: контр-адмирал Вирениус Андрей Андреевич (начальник Отдельного отряда судов, идущих в Тихий океан)
Помощник начальника ГМШ: контр-адмирал фон Нидермиллер Александр Георгиевич
Морской технический комитет (МТК)
Председатель Морского технического комитета: вице-адмирал Дубасов Фёдор Васильевич
Главный инспектор кораблестроения: генерал-лейтенант по адмиралтейству Кутейников Николай Евлампиевич
И.д. главного инспектора морской артиллерии: генерал-лейтенант по адмиралтейству Кротков Аполлон Семёнович
Главный инспектор минного дела: вице-адмирал Остелецкий Константин Степанович
Главный инспектор механической части флота: генерал-лейтенант по адмиралтейству Нозиков Николай Гаврилович
Главный инспектор строительной части: инженер генерал-майор Будзынский Станислав Константинович
Главное управление кораблестроения и снабжений (ГУКС)
Начальник ГУКС: генерал-лейтенант по адмиралтейству Любимов Лев Александрович
Начальник Отдела сооружений: контр-адмирал Родионов Александр Ростиславович
Начальник Отдела заготовлений: генерал-майор по адмиралтейству Мальцов Алексей Дмитриевич
Начальник Счетного отдела: действительный статский советник Симакин Николай Андреевич
Главное гидрографическое управление
Начальник Главного гидрографического управления: вице-адмирал Гильтербрандт Яков Аполлонович
Канцелярия Морского министерства
Директор канцелярии: действительный статский советник Стеблин-Каменский Егор Егорович
Главный военно-морской суд
Председатель военно-морского суда: адмирал Пилкин Пётр Павлович
Главное военно-морское судное управление
Главный военно-морской прокурор: тайный советник Виноградов Константин Фёдорович
Товарищ главного военно-морского прокурора: генерал-лейтенант Извеков Николай Нилович
Управление главного медицинского инспектора флота
Главный медицинский инспектор флота: почетный лейб-хирург, действительный тайный советник, доктор медицины Кудрин Владимир Сергеевич
Наместничество Е.И.В. на Дальнем Востоке
Наместник его императорского величества на Дальнем Востоке и командующий войсками в областях наместничества и морскими силами в Тихом океане
генерал-адъютант, адмирал Алексеев Евгений Иванович
Помощник командующего войсками Квантунской области: генерал-лейтенант Волков Владимир Сергеевич
Начальник временного морского штаба наместника: контр-адмирал Витгефт Вильгельм Карлович
И.д. начальника временного военного штаба наместника: генерал-майор Флуг Василий Егорович
В распоряжении временного морского штаба наместника
Мореходная канонерская лодка «Гремящий» (в ремонте): капитан 2-го ранга Николаев 1-й Пётр Егорович
Мореходная канонерская лодка «Отважный»: капитан 2-го ранга Давыдов 1-й Александр Васильевич
Мореходная канонерская лодка «Бобр»: капитан 2-го ранга Бубнов 2-й Михаил Владимирович
Мореходная канонерская лодка «Гиляк»: капитан 2-го ранга Алексеев 1-й Василий Алексеевич
Учебные суда в Талиенване
Крейсер 2-го ранга «Джигит»: капитан 2-го ранга Назаревский Александр Петрович
Крейсер 2-го ранга «Разбойник»: капитан 2-го ранга князь Ливен Александр Александрович
Стационеры в Чемульпо
Крейсер 1-го ранга «Варяг»: капитан 1-го ранга Руднев Всеволод Фёдорович
Мореходная канонерская лодка «Кореец»: капитан 2-го ранга Беляев 2-й Григорий Павлович
Стационер в Инкоу
Мореходная канонерская лодка «Сивуч»: капитан 2-го ранга Стратанович Александр Николаевич
Стационер в Шанхае
Мореходная канонерская лодка «Манджур»: капитан 2-го ранга Кроун Николай Александрович
Командир порта Артур
контр-адмирал Греве Николай Романович
В распоряжении командира порта Артур
Крейсер 2-го ранга «Забияка»: капитан 2-го ранга Лебедев 2-й Александр Васильевич
Транспорт «Ермак»: подполковник корпуса флотских штурманов Эйхен Пётр Петрович
Портовое судно «Силач»: лейтенант (к-л) Балк 2-й Сергей Захарович
Эскадра в Тихом океане (с 18.06.04 1-я эскадра Флота Тихого океана)
Начальник эскадры: вице-адмирал Старк Оскар Викторович (флаг на «Петропавловске»)
Флаг-капитан штаба эскадры: капитан 1-го ранга Эбергард Андрей Августович
Младший флагман: контр-адмирал князь Ухтомский Павел Петрович (флаг на «Пересвете»)
Младший флагман: контр-адмирал Молас Михаил Павлович (флаг на «Баяне»)
Младший флагман: контр-адмирал Лощинский Михаил Фёдорович
Отряд броненосцев
1-е отделение
Эскадренный броненосец «Петропавловск» (флаг вице-адмирала): капитан 1-го ранга Яковлев 1-й Николай Матвеевич
Эскадренный броненосец «Севастополь»: капитан 1-го ранга Чернышов Николай Кузьмич
