28 марта: начальником 2-го Управления (особых отделов) НКВД по совместительству назначен замнаркома внутренних дел и начальник УНКВД по Московской области комиссар госбезопасности 1-го ранга Л.М. Заковский.
Апрель: снят со всех должностей в НКВД и арестован замнаркома НКВД и по совместительству начальник 2-го Управления (особых отделов) НКВД СССР Л.М. Заковский. Осужден, расстрелян, в реабилитации отказано.
26 апреля: бывший начальник военной контрразведки ОГПУ-НКВД в 1931–1933 и 1936–1937 годах И.М. Леплевский арестован по обвинению в активном участии в правотроцкистской организации и проведении контрреволюционной и предательской деятельности. Осужден, расстрелян, не реабилитирован.
Май: начальником Управления особых отделов НКВД СССР назначен комбриг Н.Н. Федоров.
Июнь: между Абвером и японскими спецслужбами заключено соглашение о координации разведывательной деятельности против СССР и обмене развединформацией.
4 июня: издана директива НКВД особым отделам об аварийности в ВВС РККА. Указано: «Аварии являются результатом деятельности неразоблаченных врагов… впредь ни одной аварии без исчерпывающего агентурно-оперативного расследования не оставлять».
13 июня: бежал в Маньчжурию начальник УНКВД по Дальневосточному краю комиссар госбезопасности 3-го ранга Г.С. Люшков. Выдал японской разведке сведения о деятельности ОГПУ-НКВД, а также РККА и РККФ на Дальнем Востоке.
17 июня: издана директива НКВД об увольнении из армии всех военнослужащих иностранного происхождения.
30 июня: арестован нарком Военно-Морского Флота П.А. Смирнов. Расстрелян, реабилитирован.
15 июля: японское правительство через своего посла в Москве потребовало вывода советских пограничников с высот Безымянная и Заозерная в районе озера Хасан.
26 июля: НКВД направил на имя И.В. Сталина список из 139 лиц, подлежащих суду Военной коллегии Верховного Суда СССР с применением расстрела. В списке — высшие руководители Красной Армии и Флота, ВЧК, ОГПУ, НКВД, члены ЦК ВКП(б), военные ученые. Обвиняемых на открытый процесс не выводили. По количеству одновременно осужденных, их статусу в государственной, военной и партийной иерархии СССР, а также содержанию обвинений данный список как минимум на порядок затмил «дело Тухачевского».
27 июля: Военной коллегией Верховного Суда СССР приговорен к расстрелу бывший главнокомандующий всеми Вооруженными Силами в 1918–1919 годах И.И. Вацетис. Реабилитирован 28 марта 1957 года.
28 июля: Военной коллегией Верховного Суда СССР бывший начальник военной контрразведки ОГПУ-НКВД в 1931–1933 и в 1936–1937 годах И.М. Леплевский приговорен к расстрелу. Не реабилитирован.
29 июля: японские войска безуспешно атаковали высоты Заозерная и Безымянная, обороняемые пограничниками и подразделениями Красной Армии.
31 июля: японские войска захватили сопки Безымянная и Заозерная.
8–9 августа: частями Красной Армии японские войска выбиты с высот Заозерная и Безымянная и отброшены за пределы территории СССР.
20 августа: как «враг народа» расстрелян ВРИО начальника отдела Разведуправления РККА, видный теоретик советских спецслужб, автор труда «Агентурная разведка» К.К. Звонарев. Реабилитирован 16 мая 1956 года.
22 августа: с должности первого секретаря ЦК КП(б) Грузии первым заместителем наркома внутренних дел назначен член ЦК ВКП(б), член Президиума Верховного Совета СССР Л.П. Берия.
29 августа: Военной коллегией Верховного Суда СССР бывший руководитель военной контрразведки НКВД СССР в 1938 году Л.М. Заковский приговорен к расстрелу. Не реабилитирован.
20 сентября: принято Постановление Политбюро ЦК ВКП(б) об учете, проверке и утверждении в ЦК ВКП(б) номенклатуры ответственных работников ряда наркоматов, в том числе и НКВД.
Сентябрь — декабрь: арестованы 332 руководящих работника НКВД, проведена почти полная замена руководителей центрального аппарата, республиканских, областных и краевых УНКВД.
24—25 сентября: женский экипаж ВВС в составе В.С. Гризодубовой, П.С. Осипенко и уполномоченного Управления особых отделов НКВД М.М. Расковой на самолете АНТ-37 «Родина» совершил рекордный беспосадочный перелет по маршруту Москва — Дальний Восток.
29 сентября: на основании Постановления Политбюро ЦК ВКП(б) «О структуре НКВД СССР» Приказом НКВД объявлена новая структура Наркомата. Восстановлено ГУГБ во главе с Л.П. Берией, на базе управления особых отделов организован 4-й (Особый) отдел ГУГБ НКВД СССР.
30 сентября: Германия захватила Судетскую область Чехословакии.
25 октября: арестован бывший руководитель военной контрразведки НКВД в 1937–1938 годах Н.Г. Николаев-Журид. Приговорен к высшей мере наказания, расстрелян. Не реабилитирован.
Ноябрь: на заседании Военного совета при наркоме обороны маршал К.Е. Ворошилов заявил, что за последние два года из армии было «вычищено» более 40 тысяч человек.
Начальником 4-го (Особого) отдела ГУГБ НКВД СССР назначен В.М. Бочков.
2 ноября: уполномоченному 4-го (Особого) отдела ГУГБ НКВД летчице М.М. Расковой присвоено звание Героя Советского Союза.
9 ноября: в результате пыток и избиений следователями НКВД в Лефортовской тюрьме скончался находившийся под следствием бывший командующий Дальневосточным фронтом, Маршал Советского Союза, почетный работник ВЧК-ГПУ В.К. Блюхер.
12 ноября: застрелился начальник УНКВД по Ленинградской области комиссар госбезопасности 3-го ранга М.И. Литвин.
14 ноября: издана директива ЦК ВКП(б) об учете и проверке в партийных органах ответственных сотрудников НКВД СССР. Отмечено, что «в результате этой проверки органы НКВД должны быть очищены от всех враждебных людей, обманным путем проникших в органы НКВД, от лиц, не заслуживающих политического доверия».
17 ноября: за подписями И.В. Сталина и В.М. Молотова вышло Постановление ЦК ВКП(б) и Совета народных комиссаров СССР «Об арестах, прокурорском надзоре и ведении следствия». По смыслу и содержанию постановления вся вина за массовые репрессии возлагалась на НКВД и Прокуратуру СССР.
23 ноября: Н.И. Ежов письменно обратился в Политбюро ЦК ВКП(б) с просьбой об освобождении от должности наркома внутренних дел. В письме Ежов отметил, что «при повседневном руководстве ЦК НКВД врагов погромил здорово».
24 ноября: Постановлением Политбюро ЦК ВКП(б) Н.И. Ежов освобожден от должности наркома внутренних дел с сохранением за ним должности секретаря ЦК ВКП(б), председателя комиссии партийного контроля ЦК ВКП(б) и наркома водного транспорта.
25 ноября: руководителем НКВД назначен Л.П. Берия.
26 ноября: издан Приказ наркома внутренних дел Л.П. Берии «О порядке осуществления Постановления СНК СССР и ЦК ВКП(б) от 17 ноября 1938 года “Об арестах, прокурорском надзоре и ведении следствия”».
