Во время управления немцев в Литве действовали две полевые комендатуры — в Вильнюсе (814-я) и в Каунасе. Полевые комендатуры, запланированные для Шяуляя и Паневежиса, прибыли в Литву только в начале 1944 г. Комендатуры имели много штатных сотрудников и свой отдел управления, состоящий в большинстве своем из военнослужащих; были в них инспектора и секретарши административного совета, выполняющие задачи гражданского руководства. Комендатуры имели полицейские полномочия и их активно использовали.
Полевым комендатурам в Литве было поручено:
1) охрана железных и шоссейных дорог;
2) расквартирование военных частей;
3) организация пунктов питания;
4) обеспечение продуктами питания группы армий «Север» («Nord»);
5) поддержание дисциплины и порядка в тылу немецкой армии.
Выполнять все вышеперечисленные функции, особенно первую и последнюю, активно помогали части литовской полиции. Кроме того, в распоряжении комендатур были два батальона охраны тыла (Landesschutzen — Batallion) — 506 и 307-й, их общая численность составляла 1500 человек. Летом 1942 г. 307-й батальон был выведен из Литвы. В начале 1943 г. был получен приказ, сообщающий, что вскоре и 506-й батальон оставит территорию Литвы. Поэтому верховный полевой комендант в Литве (Oberfeldkommandant) генерал-майор Э. Юст решил завербовать среди литовцев некоторое количество юношей и как можно быстрее подготовить из них несколько полицейских рот для охраны важных объектов в Литве. По этому вопросу главнокомандующий силами вермахта в рейскомисариате «Остланд» генерал от кавалерии В. Бремер обратился к имперскому комиссару Остланда и к высшему руководителю СС и полиции в Остланде с просьбой разрешить вербовку добровольцев. Разрешение было получено. В местные комендатуры (Ortskommandanturen), которых в Литве было 21, а также во все районы, находящиеся недалеко от постов охраны железных дорог, был выслан циркуляр, объявляющий, что 1500 молодых литовцев, служивших или не служивших в полиции или в армии (включая 150 унтер-офицеров и примерно 25 младших офицеров) будут трудоустроены в литовских ротах по охране железных дорог и шоссе на территории Литвы. При этом оклад и обеспечение и т.д. будут такие же, как и в немецкой полиции. Униформа немецкая, но с литовским щитком на рукаве, и литовская кокарда на фуражке. Регистрационные бюро были при всех местных комендатурах, лишь в Вильнюсском уезде вербовка не производилась. Регистрация проходила с 15 по 31 марта 1943 г. Вышедшим из леса и добровольно зарегистрировавшимся мужчинам была гарантирована полная амнистия. За это короткое время зарегистрировалось около 1200 мужчин, среди них немало было и вернувшихся из леса.
Для обучения добровольцев в Пренае в пустующих военных казармах по приказу командира немецкой полиции порядка в Литве была создана Пренайская школа младших командиров полиции. Её административный и преподавательский персонал был набран из прибывшего в Пренай учебного батальона немецкой полиции, командир которого был назначен и комендантом школы. В школе одновременно обучались чины вновь созданных литовских батальонов вспомогательной полиции, а также чины батальонов, которые уже участвовали в антипартизанских акциях.
Из вновь завербованных добровольцев была создана учебная рота литовского батальона полиции (Ausbildungskompanie für litauische Schutzmannschafts Bataillon)
, для обучения которой было выделено около четырёх недель. Решать вопросы вновь созданной роты было поручено полковнику полиции И. Краунайтису. После медосмотра домой были отправлены все лица моложе 18 лет. Осталось около тысячи человек, из них еще около сотни отсеялось во время учёбы: часть — Из-за жалоб администрации, часть — по своей просьбе, часть — из-за дисциплинарных проступков. Было создано шесть рот по 150 человек. В середине апреля в батальоне начались занятия. Строевая муштра отсутствовала, а учебная программа включала в себя: стрельбы из винтовок, пулемётов и миномётов, метание ручных гранат, патрулирование и обезвреживание найденных мин.
1 июня 1943 г. учёба была закончена. Штаб батальона и резервная рота из 100 человек дислоцировались в Каунасе. Их основной функцией стала охрана всех объектов в городе Каунас (кроме железной дороги, мостов и туннелей), которые ранее охранялись 506-м батальоном охраны тыла. Кроме того, рота охраняла и здание главной полевой комендатуры. Остальные 800 полицейских были разделены на пять рот по 160 человек каждая. Две роты были переброшены по железной дороге в Вильнюс, а одна осталась в Каунасе охранять участок железной дороги Вирбалис — Шяуляй до границы действия комендатуры вермахта Шяуляйского уезда. Ещё одна рота была дислоцирована в Шяуляй, и ей было поручено нести охрану железнодорожных участков Шяуляй — Таураге, Шяуляй — Кретинга и Шяуляй — Латвийская граница. Оставшаяся рота была расквартирована в Паневежисе и несла охрану железнодорожного участка Шяуляй — Даугпилис до литовской границы. Все эти роты были в подчинении главной полевой комендатуры или комендантов в Шяуляе и Паневежисе. После приступления к исполнению своих служебных обязанностей литовцев немецкий 506-й охранный батальон убыл из Литвы. Лишь на каждом посту охраны железной дороги на 8–10 дней остался немецкий фельдфебель или унтер-офицер для инструктажа литовцев.
В соответствии с приказом командира немецкой полиции порядка в Литве 15 сентября 1943 г. 203 необученных полицейских из Каунаса были посланы в Пренайскую школу младших командиров полиции. Учёба должна была продолжаться 6–8 недель, однако 21 октября того же года учёба была прервана и курсанты были распределены по волостным подразделениям полиции Каунасского уезда для мобилизации рабочей силы. В школу они больше не вернулись.
Также осенью 1943 г. в Пренайской школе был организован «1-й курс командиров взводов полиции в Пренай». Курсы должны были проходить с 25 октября по 18 декабря, однако из-за организационных неурядиц они были продлены до 5 февраля 1944 г. В течение этого времени с курса по разным причинам было отчислено 60 курсантов. По окончании курсов курсанты не были распределены по частям, а остались в казармах на Зелёной горе в Каунасе.
Похожая судьба постигла и созданную из сотрудников полиции города Каунас специальную команду, отобранную на шестинедельное обучение (приказ командира немецкой полиции порядка от 21 августа 1943 г.). В команде было 68 человек, в большинстве своем старые, опытные сотрудники полиции — унтер-офицеры и старшие унтер-офицеры, отслужившие в полиции от 3 до 20 лет. Все мужчины, кроме редких исключений, были женаты и имели детей. Часть из них из-за долголетней службы страдала ревматизмом, болела разными заболеваниями. В Пренайской школе полиции эти 68 человек прошли обучение как рекруты. Учебный план был выполнен дважды, но их так и не вернули в части. Немцы планировали использовать их как полицейских во вновь созданных опорных пунктах в Паневежском уезде
.
В Каунасе при штабе офицера связи Соединений самообороны Литвы (Lietuvos savisaugos daliniai — LSD) действовали краткосрочные курсы кандидатов в офицеры, которые готовили командиров взводов для батальонов самообороны. Курсантами были отборные унтер-офицеры из разных частей, дислоцировавшихся в Литве и на Востоке. Многие из них уже прошли суровую школу войны во время долгосрочных боёв с РККА и партизанами на Востоке
. Курсы начались 24 мая 1943 г., а 31 июля программа курсов уже была окончена и курсанты убыли на полигон для стрельб и занятий по тактике. 11 августа прошёл торжественный выпуск новых офицеров.
