Антитело – см. Ат.
Апоптоз – запрограммированная гибель клеток, в отличие от некроза. Это регулируемая программа, которая активируется, когда в клетках более нет необходимости или они становятся опасными, как, например, в случае с раковыми клетками.
Археи – одна из трех основ жизни на Земле, помимо бактерий и эукариотов. Ранее они назывались архебактериями, но в настоящее это определение не используется. Археи (мн. ч.), возможно, самые древние клетки, находящиеся в основании древа жизни.
Бактериофаг – то же самое, что фаг, вирус бактерии.
БАС – боковой амиотрофический склероз – наследственное заболевание, вызывающее прогрессирующий паралич.
Белок – основной компонент живых существ, состоящий из аминокислот. Белки формируют мышцы, кожу, органы организма и т.д. – например, стейк или яйца на сковороде состоят в основном из аминокислот, коротких белков, называемых пептидами; белки с каталитической активностью являются ферментами; лишь 2% генома человека кодируют белки.
Бисульфитная конверсия – метод детекции метилированных нуклеотидов в ДНК, что является важным маркером эпигенетической регуляции, служит для различения метил-модифицированных и немодифицированных цитозинов (С); при использовании в терапевтических целях превращает С в тимин (Т), в то время как на метил-модифированные С обработка бисульфитом не оказывает действия.
Вироид – малый рибозим, РНК со стабильной замкнутой шпилько-петлеобразной структурой; в настоящее время имеет 350 оснований; часто проявляет каталитическую активность; является первой биомолекулой на нашей планете; образовался 3,9 млрд лет назад; в настоящее время наблюдается в основном в растениях, что неблагоприятно сказывается на урожайности; вирус гепатита дельта – единственный рибозим в организме человека. «Голый» вирусоподобный элемент; не кодирует белок, но взаимодействует с другими нуклеиновыми кислотами; относится к регуляторным недавно открытым circРНК, которые присутствуют во всех клетках человека, выполняя функции основного регулятора, осуществляющего титрование siРНК-молекул. В данной книге вироиды характеризуются как самые ранние биомолекулы, имеющие свойства вирусов, в силу чего возникло предположение, что вирусы – наши самые древние предки, у которых не было белковой оболочки.
Виром – все вирусы, присутствующие в образце или экосистеме, когда не выделяются отдельные вирусы.
Виросфера – мир вирусов, изображенный на постере и классифицированный Международным комитетом по таксономии вирусов.
Вирофаг – вирус, инфицирующий другой вирус, по аналогии с бактериофагом (вирусом бактерий); присутствует в гигантских вирусах, доставляет вирусы к хозяину; похож на клеточные организмы; вирофаги носят следующие названия – Sputnik или вирус Ma у гигантских вирусов; это мелкие частицы, их геномы с двухцепочечной ДНК содержат около 20 000 пар оснований; вирофаг способен уничтожить своего хозяина – гигантский вирус.
Вирус – подвижный элемент; часто состоит из генов, может содержать или не содержать белок; «вирусы, состоящие только из белка» называются прионами (как правило, их не относят к вирусам, хотя это можно было бы сделать); вирусы осуществляют перенос генетической или структурной информации; участвуют в горизонтальном и вертикальном переносе, для чего задействуют соматические и/или зародышевые клетки; используют большое количество не связанных между собой механизмов репликации; характеризуются самым большим генетическим разнообразием на планете; часто выраженное видовое разнообразие вирусов обусловлено тем, что механизмы репликации подвержены ошибкам, что приводит к образованию квазивидов, когда одновременно сосуществует большое число мутантов. ДНК-содержащие вирусы генетически более стабильны по сравнению с РНК-содержащими вирусами; у вирусов нет рибосом, исключение составляют некоторые гигантские вирусы; вирусы зависят от снабжения энергией клетками. Возможно, такой паразитический образ существования – более позднее эволюционное событие. Молекулы РНК-содержащих вирусов, в частности рибозимы, вироиды – самые древние биомолекулы, не кодирующие белок (до сих пор); вирусы способны реплицироваться без помощи клеток, но для этого им необходима энергия. В настоящее время вирусам нужны клетки для синтеза белка. Вирусы являются двигателем эволюции; они создали наш геном, в частности сформировали нашу противовирусную защиту (иммунную систему). Геном человека примерно на 50% (а ранее в эволюции, возможно, и гораздо больше) состоит из структур, относящихся к ретровирусным элементам. Возможно, они появились в самом начале формирования жизни на Земле и эволюции. Кроме того, прионы, состоящие только из белков, и рибозимы/вироиды, которые состоят только из РНК, имеют такие же свойства, как вирусы; они способны реплицироваться, мутировать, эволюционировать, защищаться, вызывать заболевания (!), поэтому их тоже можно отнести к вирусам.
Вирус «Феникс» (Phoenix) – ретровирус, полученный из клеточных эндогенных ретровирусных последовательностей, что свидетельствует о том, что эндогенные последовательности действительно произошли от вымерших ретровирусов. Эндогенные вирусы могут обеспечить защиту от экзогенных вирусов. Эндогенный ретровирус человека HERV-K(HML-2), родственный ретровирусам мышей, способен образовывать частицы, инфицировать животных и реплицироваться. Вирус «Феникс» был получен из HER-K (HML-2) последовательностей Тьерри Хайдманом. Вирусу 3 млн лет, 8% генома человека представляет собой то, что осталось от HERV, инактивация которого произошла давно вследствие мутаций.
ВОЗ – Всемирная организация здравоохранения со штаб-квартирой в Женеве (Швейцария), которая объявляет о мерах борьбы с пандемиями и программах чрезвычайных мер.
ВПЧ (HPV) – вирус папилломы человека. Рак шейки матки вызывают главным образом два из многих типов вирусов в совокупности с другими факторами. Недавно появилась вакцина, которую вводят молодым девушкам, а скоро ею будут вакцинировать и мальчиков.
Ген – единица генома, кодирующая белки, из которой состоит организм человека и которая участвуют в метаболизме; у эукариотов один ген может кодировать более одного белка; гены состоят из экзонов и интронов; экзоны – это кодирующие белок участки; интроны удаляются путем «сплайсинга», расщепление и присоединение РНК-транскриптов обеспечивает наличие большого количества комбинаций и определяет сложность организма человека.
Геном – полная генетическая информация о любом виде, которая, как правило, представляет двухцепочечную ДНК, наследуется и присутствует во всех клетках, состоит из генов, а также из некодирующей генетической информации, что означает не кодирование генных продуктов, например, выполняющих регуляторные функции.
Герцептин – препарат для лечения рака легких, применяется только в отношении 25% пациентов с дефектом гормональной сигнализации (включающей рецептор эпидермического фактора роста (EGF).
Гигантские вирусы, или гигавирусы – необычайно большие вирусы, к хозяевам которых относятся амебы и морские водоросли; рассматриваются как «почти бактерии», отмечают, в частности, мимивирус (мими означает мимикрирующие (подражающие) бактериям в силу их необычно больших размеров). Имеют следующие названия: mama-, marseille-, pandora-, pitho-, samba-, molliviruses. Гигантские вирусы имеют крупные геномы, имеющие до 2,5 млн пар оснований; к гигантским вирусам морских водорослей, в частности, относится EhV-86, инфицирующие Emiliania huxleyi, а также вирусы Chlorella. Гигантские вирусы являются хозяином для более мелких вирусов (вирофаги) и содержат компоненты, необходимые для синтеза белков. Можно предположить, что гигантские вирусы являются либо вырожденными бактериями, либо неполными предшественниками бактериальных клеток с незаконченным эволюционным развитием.
