В 1790 г. Войску верных казаков черноморских были отведены земли для поселения по берегу Черного моря между реками Днестр и Южный Буг. После войны Войско переименовали в Черноморское казачье войско и в 1792—1794 гг. переселили на Кубань для несения пограничной службы. К 1812 г. строевой состав войска состоял из 10 конных и 10 пеших полков и Черноморской сотни в составе Лейб-гвардии казачьего полка. Из казаков пеших полков, кроме прочего, формировалась казачья флотилия.
В кампании 1812 г. участвовали Черноморская сотня и 9-й сборный пеший полк, позже, в 1813 г., на войну с Наполеоном был отправлен 1-й сборный конный полк
.
Черноморская сотня Лейб-гвардии Казачьего полка была сформирована по предписанию военного министра херсонскому военному губернатору герцогу Э.О. Ришелье от 18 мая 1811 г. В сотню отбирали по 10 человек от каждого полка Черноморского казачьего войска, причем старались набрать казаков «из лучших людей», «хорошего состояния, доброго поведения, здоровья, ростом и лицом видных» (рост от 173 до 191 см). Набирались казаки, имевшие опыт полевой службы, так что средний возраст их составлял примерно 30 лет. На вооружении у казаков были сабли, ружья и пистолеты. Огнестрельное оружие, по свидетельству очевидцев, было «на манер черкесский» или «на манер турецкий». Командиром сотни был назначен войсковой полковник А.Ф. Бурсак. Сотню сформировали за два месяца в составе 5 офицеров, 14 урядников, 2 трубача и 100 казаков. 1 марта 1812 г. сотня прибыла в Санкт-Петербург и вошла в состав Лейб-гвардии казачьего полка.
В составе этого полка сотня провела всю кампанию 1812 г., участвовала в Бородинском сражении, в Тарутинском сражении, в боях при Вязьме, Дорогобуже, Ляхове, Красном и Вильно. В декабре 1812 г., с прибытием императора Александра I в действующую армию, сотня состояла в его охране. В апреле 1813 г. Черноморскую сотню велено было «содержать во всем на положении Лейб-казачьего полка, оставляя только форму обмундирования в прежнем виде, а офицеров переименовать в чины соответственно Лейб-казачьему полку».
В 1812 г. личный состав Черноморской сотни имел форму казачьего типа: «Шапка меховая баранья с алым шлыком, свисавшим направо. Подбородный ремень черный кожаный. В парадной форме к шапке полагались белый султан (носился слева) и желтый этишкет с гайками и кистями. В походе шапка имела чехол из черной материи. Полукафтан алого сукна застегивался на груди на крючки. Воротник и прямые обшлага черные с белой выпушкой и гвардейскими петлицами. Верхний полукафтан темно-синий с воротником и обшлагами, как на алом полукафтане, имел разрезы подмышками у рукавов, в которые просовывались рукава алого полукафтана (рукава темно-синего полукафтана носились закинутыми за спину). На плечах жгуты из желтых шнуров придерживали откидные рукава и застегивались у плеча алого полукафтана. В начале 1812 г. воротники курток стали прямыми и низкими, а петлицы на воротнике и обшлагах — из желтого басона с красными каемками по краям и с черным просветом в центре. Шаровары темно-синего сукна, широкие навыпуск, с желтым двойным лампасом и желтой обшивкой по нижнему краю, штрипка черной кожи. Сапоги со шпорами. Вооружение — пика с красным древком без флюгера, сабли разных образцов, пистолеты (носились за поясом или на крючке перевязи), ружья (носились за спиной на погонном ремне). Перевязь для пистолета из белой кожи, лядунка — красной кожи на красной перевязи. Конское снаряжение казачьего образца, чепрак темно-синий, подушка красная с обшивкой желтого басона. Урядники имели серебряные галуны на воротнике и на обшлагах, султан с черной верхушкой. Трубачи имели на плечах рукавов красные крыльца, куртки расшиты желтым гвардейским басоном на груди, крыльцах, рукавах и по всем швам, султаны у шапок красные. Офицеры носили на плечах жгуты из серебряного шнура, на обшлагах и на воротнике — серебряное шитье особого образца. Этишкет шапок серебряный, султаны — с черно-оранжевым основанием. Лампасы на шароварах — серебряного галуна. По поясу в строю носился серебряный офицерский шарф. Офицерам разрешалось носить прибивные (привинтные) шпоры
. 9-й сборный пеший полк Черноморского казачьего войска был сформирован в феврале 1807 г. из казаков различных полков для участия в Русско-турецкой войне 1806—1812 гг. Полком командовал войсковой старшина Г.К. Матвеев. Первоначально полк назывался «3-й приморский казачий полк» и действовал в составе Дунайской флотилии. После окончания войны с Турцией полк в составе Дунайской армии был переброшен на борьбу с наполеоновским нашествием и принял участие в боях в составе корпуса генерал-лейтенанта П.К. Мусина-Пушкина. Личный состав давно не пополнялся, и к ноябрю 1812 г. в составе полка числилось 2 штаб-офицера, 10 обер-офицеров, 8 унтер-офицеров, 254 рядовых. Во время боев, с 21 октября 1812 г. по 1 февраля 1813 г., полком командовал войсковой полковник П.Ф. Бурсак. Основную тяжесть боев полк вынес на территории Польши в конце 1812 — начале 1813 г. 9 декабря 1812 г. полк участвовал в бою при местечке Окопов, 20 декабря — при местечке Дубенка, 1 января 1813 г. — при местечках Ухань и Сливочов, 2 февраля — при Владиславиче и Красноставе.
2 августа 1813 г. из местечка Хелме 9-й сборный пеший полк был отправлен обратно на Кубань, куда прибыл 16 октября того же года
.
1-й сборный конный полк Черноморского казачьего войска был сформирован в марте 1813 г. из казаков конных и пеших полков специально на подкрепление иррегулярных войск. Командовал полком есаул Д.С. Плохий. 29 марта 1813 г. полк выступил из Екатеринодара в поход на Брест-Литовск. На 6.6.1813 г. в составе полка числилось 15 обер-офицеров, 11 сотенных есаулов, 547 казаков. Прибыв на театр военных действий, с сентября 1813 г. полк действовал в авангарде летучего корпуса ген. М.И. Платова. В кампанию 1813г. участвовал в сражениях и боях при Гохкирхене, Альтенбурге, Хемнице, Лейпциге, Веймаре и др., в кампанию 1814 г. — при Вильнев-Леруа, Немуре, Арси-сюр-Об, Сезане, Фер-Шампенуазе и др. В марте 1814 г. полк вместе с другими частями армии союзников вошел в Париж. Потери полка убитыми и умершими были относительно невелики — 2 офицера и 56 казаков
.
11 апреля 1814 г. Платов собирался во Франции «вместо Костина полка оставить Черноморский полк, как исправней других лошадьми и имеющий в комплекте более 400 человек казаков»
.
Барклай де Толли Платову ответил: «А как войско Черноморское защищает полуденные границы России, то и не могу я согласиться на таковую перемену»
.
Полк был отправлен на родину и вернулся в Екатеринодар 31 октября 1814 г.
Вместе с донскими казаками в войнах с Наполеоном принимали участие казаки Бугских полков.
Бугское казачье войско было создано 8 мая 1803 г., но ведет свою историю от полка задунайских христиан (молдаван, валахов, болгар, сербов, черногорцев и македонцев) поселенного в 1774 г. на р. Южный Буг. В 1785 г. из этих поселенных казаков сформировали Бугский конный казачий полк. В 1787—1796 гг. бугские казаки входили в состав Екатеринославского казачьего войска, возглавляемого М.И. Платовым. После расформирования Екатеринославского казачьего войска Бугский конный казачий полк, а также выходцы из южнославянских земель, жившие на землях бугских казаков, в 1803 г. были объединены в Бугское казачье войско, имевшее к 1812 г. 3 казачьих полка.