26 мая 1921 года объединенными усилиями антибольшевистских организаций во Владивостоке был произведен переворот. Восставшие в городе каппелевцы получили подкрепление: со стороны моря на барже, шедшей на буксире катера, показался десантный отряд под командой капитана 2-го ранга Алексея Васильевича Соловьева. Этот отряд, состоявший исключительно из моряков, был встречен сильным ружейным и пулеметным огнем с большевистских судов. Впрочем, все же очень скоро, несмотря на понесенные потери, отряд умудрился высадиться у памятника адмиралу и путешественнику Невельскому и постепенно овладел городским портом. Через два дня во Владивостоке снова воцарилось полное спокойствие. Командующим Белыми войсками и флотом был назначен генерал-лейтенант Вержбицкий, а командующим Сибирской флотилией — отважный капитан 2-го ранга Соловьев. В период, последовавший за переворотом, Сибирская флотилия насчитывала 25 судов.
18 июня 1921 года вступил в командование Сибирской флотилией прибывший во Владивосток контр-адмирал Георгий Карлович Старк. Командующий флотилией созвал военный совет под своим председательством для обсуждения текущего положения дел и выработки программы совместных действий гражданской администрации, сухопутных сил и флота на Дальнем Востоке. В состав совета вошли два контр-адмирала: Вениамин Иванович Подъяпольский, оставшийся во время будущей эвакуации в городе, и Василий Викторович Безуар, ушедший вместе с эскадрой Старка и обосновавшийся впоследствии в Китае. Был приглашен и инженер-механик генерал-лейтенант Андрей Иванович Ухлин. Вместе с ним в совет вошли военный инженер, полковник морской строительной части в Либаве в годы Первой мировой войны Александр Иванович Ярон и три капитана 1-го ранга: Александр Николаевич Пелль, оставшийся в РСФСР и погибший в лагерях в 1930-е годы, Николай Георгиевич Фомин, бывший начальник команды ледоколов на озере Байкал, входивший в окружение атамана Семенова и доживавший остаток дней своих на Австралийском континенте, и Николай Сергеевич Харин, успешно воевавший в составе Сибирской флотилии с 1918 года. В состав совета был принят и старший лейтенант Георгий Семенович Серебренников.
После совещаний и обсуждений дальнейших шагов флота командующий Сибирской флотилией контр-адмирал Старк отдал по флотилии приказ, закончив его требованием от всех чинов флота и Морского ведомства полного подчинения, забвения личных интересов и спокойной и дружной работы на общее благо. Это позволило вывести флотилию из сферы политических распрей, царивших во Владивостоке, и заняться текущей флотской работой.
К осени 1921 года корабли имели некоторое вооружение и винтовки, неофициально полученные от японского морского командования под предлогом необходимости вооружения морской милиции. В октябре того же года из добровольцев была сформирована отдельная рота морских стрелков. 23 сентября 1921 года во Владивосток прибыл пароход «Франц Фердинанд». На нем приехали из Месопотамии интернированные русские беженцы, среди которых был и личный состав Каспийской флотилии под командой капитана 1-го ранга Пышнова, числом около 80 офицеров и свыше 200 матросов всех специальностей. Этот отряд, отступивший в свое время через Энзели и Персию в Месопотамию, после крушения южно-русского правительства генерала Врангеля был интернирован британцами. Они содержали русских людей на положении пленных в лагере Танум, вблизи порта Басра. Впрочем, в августе 1921 года британцы посадили весь отряд на уходивший из Месопотамии транспорт «Франц Фердинанд» и отправили во Владивосток.
С прибытием месопотамских сидельцев боеспособность Сибирской флотилии значительно повысилась не только в смысле уровня технических знаний в среде личного состава, но также возрос и боевой дух. Люди этого отряда, из которых часть участвовала в походе генерала Корнилова, часть происходила из Морской роты капитана 1-го ранга Потемкина и большинство являлись офицерами Балтийского флота, — были чужды приморской политике и потому, не раздираемые никакими внутренними интригами, принесли с собой особое дружное настроение, необходимое для успеха любой работы. Прибытие нескольких молодых штаб-офицеров и лейтенантов позволило командующему флотилией произвести замену ряда чинов своего штаба, а также некоторых командиров кораблей. Временно исполняющим обязанности начальника штаба и флаг-капитана по распорядительной части был назначен вновь прибывший, получивший чин капитана 2-го ранга Анатолий Павлович Ваксмут. Капитан 2-го ранга, начинавший свою службу еще в Гвардейском экипаже, Сергей Николаевич Гарковенко был назначен командующим флаг-капитаном по оперативной части. Работа по усилению кадрового состава флота продолжалась полным ходом. Были сделаны некоторые назначения. Капитан 2-го ранга Сергей Яковлевич Ильвов, лейтенант Иван Васильевич Тихомиров и старший лейтенант М. Сафронов волей командующего были отправлены командовать миноносцами «Твердый», «Инженер-механик Анастасов» и «Бойкий».
Старший лейтенант Владимир Алексеевич Буцкой был назначен командиром посыльного судна «Илья Муромец». 25 августа 1922 года, когда «Илья Муромец» под командованием старшего лейтенанта Буцкого со взводом морских стрелков вышел из Владивостока и до 31 августа держался в районе Джигит-Терней-Самарга, ими был захвачен японский моторный катер с тремя вооруженными красными партизанами. Под покровом ночи катер шел с почтой от красного начальства из Тетюхэ в Терней. Факт этот лишь подтверждал сведения, что большевики за деньги пользовались японскими судами и катерами для перевозки небольших частей и почты! 28 августа началась эвакуация японскими войсками Спасского района, а затем, в течение сентября, и Владивостока, в которой активно участвовало и посыльное судно «Илья Муромец» со своим деятельным командиром.
Любопытно, что во время знаменитого исхода эскадры Старка на Филиппины Владимир Алексеевич оставался при кораблях, исполняя должность корабельного священника. В эмиграции в Китае Буцкой оказался востребован как отменный гидрограф и навигатор. Ему принадлежит пальма первенства в составлении навигационных карт великой китайской реки Янцзы по поручению британской навигационной компании, в которой старший лейтенант был вынужден служить, чтобы хоть как-нибудь свести концы с концами, пока в 1931 году китайские власти не предложили русскому морскому офицеру возглавить военно-морское училище в Шанхае. Во время Второй мировой войны Владимир Алексеевич был взят в плен японцами и провел в японском лагере восемь долгих месяцев. После войны, когда мир стал стремительно меняться, Буцкой с семьей переехал в Южную Европу, поселившись в Италии, проживал в Риме и зарабатывал на жизнь тем, что, обладая представительной внешностью, снимался во многих итальянских фильмах. Режиссеры не жалели для русского эмигранта даже главных ролей, ибо на Буцкого шла публика и доходы от проката фильмов с его участием оказались внушительными. Владимир Алексеевич Будкой скончался в Риме в конце 1967 года.
В ходе проведенных кадровых изменений во Владивостоке адмиралом Старком была учреждена и должность флагманского интенданта, на которую был назначен старший лейтенант Владимир Анатольевич Гинтер, также окончивший свои дни на экзотической чужбине — в Гонконге. Плавучие средства порта, укомплектованные прежде вольнонаемным составом, были полностью заменены военнослужащими из числа прибывших беженцев на приснопамятном «Франце Фердинанде». Заведующим плавучими средствами без колебаний Старк поставил капитана 1-го ранга Бориса Михайловича Пышнова, который и оставался в этой должности до конца пребывания Белой флотилии во Владивостоке.
