Попав в Святую палату, пленник подвергался допросам. При этом инквизиторы делали все, чтобы воздействовать на психику человека. Комната обычно была задрапирована черной материей, сквозь окна не проникало света. На столе, покрытом черным бархатом, стояло распятие и шесть горящих свечей, а также лежала Библия. У стола стояла кафедра, за которой сидел секретарь, зачитывавший список преступлений, вменяемых задержанному. За столом сидели инквизиторы в белых монашеских одеждах с черными клобуками. Позади пленника в ряд выстраивалась стража, доставившая его в здание инквизиции. Старший инквизитор обычно некоторое время не обращал внимания на арестованного, делая вид, что поглощен изучением бумаг, лежавших на столе. Это делалось по инструкции, а также с целью увеличить тревогу и растерянность пленника. Потом секретарь задавал вопросы о его имени, адресе и т. п., а старший инквизитор, отложив бумаги, спрашивал, знает ли подозреваемый, за что он арестован. Бедняга отвечал, что не знает за собой никакой вины, после чего инквизитор снова углублялся в чтение. Затем у несчастное допытывались, есть ли у него враги, как часто он исповедуется, какого он прихода, кто духовник и когда подозреваемый последний раз был на исповеди.
Инквизиторов предупреждали, что страх, растерянность, слезы и жалобы жертвы не должны производить на них впечатления. Им напоминали, что не следует забывать о коварстве еретиков. Разве они не притворялись католиками, тайно предаваясь ереси? Инквизиторам следовало помнить, что осуждение одного еретика может означать спасение для тысяч людей, так как многие еретики увлекали за собой других на путь греха и противодействия Господу и церкви.
Цель допросов состояла в том, чтобы заставить задержанного покаяться, а также, по возможности, обвинить в ереси своих родственников и знакомых.
Если, однако, человек упорно молчал в ответ на задаваемые вопросы, то применялась иная тактика. Инквизитор делал вид, что сочувствует пленнику, говорил, что не желает ему вреда, что он смотрит на пленника как на заблудшее дитя и желает, чтобы он возвратился на путь истинный. Для этого необходимо покаяться, и тогда узник снимет бремя греха со своей души, почувствует облегчение и получит прощение церкви. Но искреннее раскаяние предполагает ненависть к ереси. Поэтому покаявшийся должен назвать имена других людей, совершающих грех втайне. Покаявшиеся должны и другим дать возможность покаяться. Этот прием действовал достаточно успешно. Многие попадались на эту уловку, и новые узники появлялись в тюрьмах инквизиции. Если, однако, человек продолжал настаивать на собственной невиновности, то применялись более изощренные приемы. Например, человека могли поместить в более удобную камеру, чем раньше, и допускать к нему избранных посетителей, которые должны были вести с заключенным доверительные беседы и уговаривать покаяться, после чего он получит мягкое наказание. Арестованный не знал, что в укромном месте находился один из инквизиторов, который слышал все, что говорилось во время этих бесед. Если этот прием не давал нужных результатов, то в камеру могли подсадить нового «узника», который в действительности был агентом инквизиции. Во время длительных бесед с обвиняемым этот агент, притворяясь еретиком, должен был спровоцировать настоящего узника на саморазоблачение. Если и это не помогало, заключенного снова вызывали к инквизиторам, которые подвергали его перекрестному допросу, быстро задавая вопросы до тех пор, пока утомленный и сбитый с толку узник не начинал противоречить самому себе.
Тогда ему говорили, что он лжет, и уводили. После этого его должны были отправить в камеру пыток.
Со времен Торквемады пытки стали важной частью деятельности инквизиции. Прежде они применялись не часто. Король Франции Филипп IV в одном письме упоминает о пытках еретиков, в то время недавно введенных инквизицией, и осуждает жестокость этой меры (что не мешало ему применять их, когда он считал нужным, как в случае с храмовниками). Папа Климент V, получая жалобы от тех, кого пытали в инквизиции, велел организовать расследование этих случаев. За период с этого времени (с начала XIV в.) и до введения инквизиции в Испании сохранилось не так много записей о применении пыток (хотя, вероятно, далеко не все такие случаи записывались).
Согласно статье 15 «Указаний» Торквемады, инквизиция имела право применять пытки в случае, когда грех ереси считался «полудоказанным». Правда, имелось указание, что инквизиторы не должны проливать кровь, так как священники не имеют право это делать. Может показаться, что в законах инквизиции было и что-то от духа настоящего христианства, но это не так. Если во время применения пытки жертва вдруг умирала, то ответственный за это инквизитор должен был немедленно получить отпущение греха у своего товарища, — Торквемада дал монахам право взаимного отпущения грехов.
Пытка состояла из нескольких этапов, причем благочестивые инквизиторы именовали ее не пыткой, а допросом. Торквемада положил в основу своих «Указаний» многие положения арагонского Великого инквизитора Эймерика и инквизитора Бернарда Гун, живших в XIV в. Эймерик предложил пять стадий допроса с применением пыток, с тем чтобы на каждой стадии была возможность добиться от узника показаний.
Первой стадией было запугивание применением пыток. Вторым этапом был визит в камеру пыток, где инквизиторы демонстрировали пленнику все орудия пыток, находившиеся в их распоряжении. Этот этап считался очень важным. На третьем этапе, который должен был еще больше запугать арестованного, его раздевали и готовили к началу пытки. На четвертой стадии ему демонстрировали то орудие пытки, которое должно было быть к нему применено. Если он и на этот раз не каялся в ереси и не называл сообщников, то пытка начиналась.
Согласно закону, запрещалось повторять пытку, и человек, после первого испытания настаивавший на своей невиновности, не должен был подвергаться повторным испытаниям. Поэтому инквизиторы стремились, чтобы обойти закон, не «повторять», а продолжать пытку как можно дольше, давая жертве лишь краткие передышки.
Чаще всего в тюрьмах инквизиции применялись дыба, «подъемник», и пытка водой. «Подъемник», как самый простой, но в то же время болезненный прием, применялся чаще других. Жертве связывали руки за спиной и начинали медленно поднимать с помощью блока, так, чтобы все тело держалось на руках. Через несколько минут человека опускали вниз и предлагали покаяться. Если же он отказывался, его поднимали снова, а если и после этого он не признавал себя виновным, могли привесить к ногам гири. Когда человек терял сознание, его снимали, давая ему передышку, чтобы через некоторое время повторить все сначала.
Распространена была в тюрьмах инквизиции и пытка ъодой. В этом случае жертву привязывали к наклонной лестнице, так, чтобы человек не мог пошевелить ни руками, ни ногами, рот насильно держали открытым, ноздри закрывали деревянными затычками, а рот прикрывали куском ткани. Затем жертве медленно наливали воду в рот из кувшина. Человек автоматически делал глотательные движения, и вместе с водой в горло попадала ткань. Потом полуживому от удушья арестанту давалась передышка, чтобы через некоторое время все повторить вновь.
Кроме дыбы и пытки водой применялся, «испанский стул». Человека усаживали на стул, зафиксировав руки и голову, а ноги помещали у жаровни. Это была пытка раскаленными углями. Применялось также отрезание пальцев на руках или ногах, битье кнутом и другие виды пыток.