В конце концов даже доктор Константине и доктор Бланке попали в тюрьму инквизиции.
В то время как в Севилье происходили указанные события, инквизиции стало известно, что в Вальядолиде тоже есть протестантская колония. Главой этой общины был дон Карлос де Сесо, который считался сыном епископа Пиасенсы, ставшего реформистом. Он быстро принял протестантизм. Среди его единомышленников были Антонио де Эрресуэло и его супруга Леонора де Сиснерос. Кроме того, в общине состоял Хуан Санчес, который так ревностно относился к делу, что подвергал своих товарищей риску. Он был любимым проповедником Карла, который брал его с собой в Германию. Возможно, находясь в одной из таких поездок, Хуан Санчес стал членом реформаторской церкви.
Когда Санчес приехал в Вальядолид, он связался с домом доньи Каталины де Ортеги и обратил ее в протестантскую веру. Педро де Касалья, парижский священник, ставший ревностным протестантом, его сестры донья Беатрис и донья Констанца де Виверо, его братья Агустин де Касалья и Франциско вместе с Хуаном Виверо собирались на встречи в доме своей матери Леоноры де Виверо.
Эти встречи, продолжавшиеся многие месяцы, не могли остаться незамеченными. Люди знали, что единственным способом избежать подозрений инквизиции было шпионить для церкви. Одной из обращенных в протестантизм была донья Ана Энрикес, дочь маркизы де Альканьизес. Очевидно, некий Кристобаль де Падилья, который был ее управляющим, слишком много говорил. Он был арестован, и группа единомышленников, не имевшая оснований надеяться на его осмотрительность, была сильно встревожена.
Бегство было практически невозможным, поскольку инквизиция была уже настороже, однако некоторые пытались спастись. Убежать смог только Санчес, но через год и он был пойман и отдан под суд.
Великим инквизитором в ту пору был Вальдес, архиепископ Севильский. Вальдес посчитал обнаружение протестантов в Вальядолиде и Севилье блестящим успехом в своей карьере. Ему нужно было не только доставить народу удовольствие, но и показать королю, какую важную роль он играет. Он был на грани бесчестия, и это дело показалось ему удобным для того, чтобы вернуть былой престиж.
Король Филипп II вел войны и срочно нуждался в деньгах. Поэтому он обратился к своим вассалам за помощью. Поскольку король был во Фландрии, принцесса Хуана, его сестра, исполнявшая в тот момент обязанности правителя королевства, потребовала у Вальдеса 100 000 дукатов.
Вальдес не готов был платить, и за это получил порицание короля. Однако он понимал, что, отказав королю в просьбе, подвергает себя опасности, и, пытаясь оправдаться, утверждал, что Филиппу не стоит брать деньги у священников, поскольку в этом деле надо полагаться на Божью помощь.
Тем временем Филипп послал указание отлучить Вальдеса от двора, хотя мог предложить ему сделать это по собственному желанию.
Но с обнаружением протестантов в Севилье и Вальядолиде Вальдес, без сомнения, почувствовал, что у него появилась возможность показать, как он полезен государству, и заодно придержать деньги. Поэтому он стал распускать ужасные слухи о протестантах, говоря, что они устраивают ужасающие оргии по всей стране.
Тем временем скончалась Хуана, душевнобольная королева, и принцесса Хуана, будучи в то время правительницей королевства, приказала Вальдесу перевезти ее тело в Гранаду. Вальдес отказался сделать это. Он сказал, что с похоронами можно подождать и что самое главное — уладить дела с протестантами в Севилье и Вальядолиде.
Обнаружение протестантов полностью изменило отношение Карла и Филиппа к Вальдесу, так как Великий инквизитор приобрел славу. Вместо требования оставить двор, ему теперь было приказано остаться.
Находившийся в Юсте Карл, близкий к смерти, был сильно обеспокоен. Он написал Хуане (послав копию письма Филиппу во Фландрию), убеждая ее не проявлять снисходительности к протестантам, представляющим, по его мнению, большую угрозу для страны.
В результате расследований в Вальядолиде и Севилье состоялись пресловутые аутодафе.
Первое аутодафе состоялось в воскресенье на Троицу 21 мая 1559 г., и на нем были казнены первые узники из Вальядолида.
Вальдес, решивший показать свою большую значимость, объявил об аутодафе за пятьдесят дней до приведения приговора в исполнение. Он приставил к заключенным вооруженную гвардию, поскольку желал показать, что лютеране представляют большую угрозу и что их следует конвоировать.
За день до аутодафе состоялась церемония несения символов сожжения. Церковные служители вышли из дворца инквизиции и, достигнув городской площади, развернули знамя, на котором был начертан указ, запрещавший горожанам носить оружие до окончания аутодафе и ездить по улицам верхом или в карете во время прохождения процессии.
После этого к процессии присоединились монахи из окрестностей, собравшиеся возле тюрьмы инквизиции, и пошли вместе с альгвасилами и другими служителями, держа в руках белые свечи. В центре процессии возвышался стенд, покрытый мантией. Участники процессии пели, идя по площади. Там уже был воздвигнут эшафот, и на нем был алтарь. Затем подняли мантию, и взорам шедших открылся зеленый крест, прикрытый черным покрывалом.
Он был возложен на алтарь, и некоторые участники процессии остались охранять его на ночь, а другие ушли домой.
На следующий день состоялось аутодафе. Жертвы были собраны вместе, им обрили головы и остригли бороды, одеты они были в основном в грубую верхнюю одежду, без обуви и чулок, многие были в «санбенито».
Аутодафе, состоявшееся на Троицу в воскресенье в 1559 г., известно не только тем, что на нем пострадали протестанты Вальядолида, но и тем, что на нем впервые присутствовали члены королевской семьи. На нем принцесса Хуана, сестра Филиппа II, которая правила страной в отсутствие брата, и с ней был принц, сын Филиппа дон Карлос.
Члены королевской семьи были окружены множеством придворных, и вид их был великолепен. Впереди жертв несли мертвое тело Леоноры де Виверо. Этой женщине просто посчастливилось умереть во время суда, но кое-какие люди сказали под пыткой, что она придерживалась лютеранских взглядов и позволяла устраивать у себя дома встречи лютеран. Поэтому ее тело было выкопано, завернуто в «санбенито», пронесено по улице и затем публично сожжено.
Дом, в котором проходили встречи, был сожжен дотла, на его месте была установлена табличка с надписью, что в период правления папы Павла IV и короля Филиппа II священная инквизиция постановила разрушить дом Педро де Касалья и Леоноры де Виверо, поскольку в нем собирались на сборища лютеране, выступая против святой католической веры и Римской церкви.
Другой жертвой был сын Леоноры, доктор Агустин де Касалья, который был каноником Саламанки. Он отрицал свою причастность к лютеранству, но под угрозой пыток сдался и признался, что желает примириться с католической церковью… Инквизиторы дали ему понять, что церковь сможет его простить, если он чистосердечно исповедуется и даст более подробную информацию о других людях, которые состояли в протестантской общине. Когда он сказал, что у него больше нет сведений, ему грубо ответили, что если он не будет говорить, то умрет на следующий день. Поэтому он стал готовиться к смерти, сказав, что умрет без лжи и не будет подвергать страданиям других.