11 августа «Куин Мэри» в первый раз после 1939 г. пришла в Саутхемптон. Город и порт были сильно разрушены германскими бомбардировками, но это не повлияло на теплоту приема, оказанного горожанами своей любимице. Радость саутхемптонцев была, наверное, еще более безграничной, чем в Нью-Йорке и в Гуроке: ведь здесь от «Королевы» зависела работа и благополучие очень многих людей. Кроме того, 14 числа пришло радостное известие о капитуляции Японии. Вторая мировая война завершилась.
По окончании войны в США началось осуществление программы репатриации в кратчайшие сроки американских военнослужащих с заморских театров военных действий. Администрация Трумэна сделала для этого все возможное, привлекая для перевозки военнослужащих все имеющиеся в наличии пассажирские суда, а также десантные и грузовые транспорты, и даже боевые корабли и плавучие госпитали. В их числе и трофейные «Королевы» и старушка «Аквитания» приняли деятельнейшее участие в репатриации: эти суда к октябрю 1945 г. перевезли на родину более 500 тыс. человек, что составляло четверть от общего числа репатриированных военнослужащих США.
Тем временем в Англии все чаще стали высказываться за возвращение в эксплуатацию в английских интересах трех кунардовских лайнеров. Ведь правительство США взяло их в аренду — в первую очередь, для переброски сил на Тихоокеанский театр после победы в Европе. Однако по окончании войны эта договоренность утратила силу. Но, между тем, английские лайнеры переправляли на родину американцев, а не англичан. В середине октября британский премьер-министр Клемент Эттли договорился с Трумэном о том, что «Куин Элизабет» и «Аквитания» будут возвращены на родину, а репатриацией американцев будет заниматься лишь «Куин Мэри». Впрочем, и этого было вполне достаточно для того, чтобы к январю 1946 г. усилиями «Королевы» и задействованных американских кораблей и судов большая часть американских военнослужащих, находящихся в Европе и не связанных с оккупационными работами, была возвращена домой.
Задача по репатриации была признана «в целом выполненной», и «Куин Мэри» освободили от ее обязанностей. Впрочем, могучей «Королеве» нашлось еще одно дело: доставка в США жен и детей американских военнослужащих иностранного происхождения. Эта операция получила название «Диапер». Только в Европе насчитывалось 60 тыс. человек, которых предстояло перевезти в Америку, еще 6000 находились в Австралии и Новой Зеландии. Английское правительство для выполнения этой благородной миссии согласилось оставить «Куин Мэри» под американским контролем до мая 1946 г.
14 января «Королева» встала на ремонт и очередное переоборудование в док «Кинг Джордж V» в Саутхемптоне. 16 дней лайнер освобождали от военного оборудования, разоружали и перепланировали пассажирские помещения. Единственное оборудование, которое по зрелому размышлению решили оставить, была система размагничивания, поскольку германские магнитные мины еще могли представлять реальную опасность.
Нью-Йорк, Триумфальная встреча «Куин Мэри» с американскими военными на борту
После демилитаризации лайнера решено было, по возможности, восстановить прежнее внутреннее убранство и интерьеры, так как отныне его пассажирами должны были стать гражданские лица, женщины и дети. Судно должно было перевозить за рейс около 1200 пассажиров, не считая обслуживающего персонала, сотрудников миссии Красного Креста, нянечек и докторов. В каждой каюте поставили по шесть мягких кроватей. Помещения, предназначавшиеся для беременных женщин, снабдили звонками для вызова нянечек из бортового госпиталя. Заскладированные на берегу элементы интерьера вернули на свои места. Пищевые раздаточные пункты вновь превратили в столовые, на главной палубе открылись магазины. Корпус лайнера очистили от обрастаний, провели профилактику машин и механизмов.
5 февраля «Куин Мэри» отправилась в Нью-Йорк с 2451 пассажиром на борту — в основном это были женщины и дети. Пять дней спустя первое послевоенное плавание в новом качестве успешно завершилось. В обратном рейсе «Королева» взяла на борт 1720 коммерческих пассажиров. В течение трех последующих месяцев подобные рейсы превратились в обычную рутинную работу. За пять рейсов судно переправило 12200 человек.
1 мая 1946 г. лайнер окончательно перешел под британский контроль и продолжил выполнять ту же работу, но уже на маршруте Саутхемптон — Галифакс — Нью-Йорк — Саутхемптон. Теперь его пассажирами стали жены и дети канадских военнослужащих. За один рейс в Канаду перевозилось около 2200 человек. На обратном пути лайнер брал около 2000 коммерческих пассажиров. К концу этой службы «Королева» перевезла в Канаду 18900 членов семей военнослужащих и более 10000 платных пассажиров из Америки в Европу. Демобилизовали лайнер 27 сентября, по возвращении в порт приписки из очередного рейса. Наконец закончилась полная опасностей шестилетняя военная служба «Королевы» королю и Отечеству. За этот период лайнер прошел 600 тыс. миль и перевез более 800 тыс. человек, сыграв важную роль практически во всех военных кампаниях союзников. «Куин Мэри» стала первым военным транспортом в истории, переправившим за один рейс дивизию в полном составе. Лайнеру принадлежит и еще один рекорд: в одном рейсе на борту «Куин Мэри» находилось одновременно 1 6500 человек! Несмотря на то, что за лайнером велась серьезная охота, судно ни разу не подверглось атаке неприятеля. Во время войны у «Куин Мэри» появилось прозвище «Серый призрак», связанное не только с ее светло-шаровой окраской, но и с тем недюжинным умением буквально «растворяться» в океане, которым и было обусловлено везение, не раз помогавшее ей избежать встречи с врагом. Это умение явилось всецело заслугой британских военно-морских планировщиков, чей труд помог уберечь в войну не только «Королеву», но и десятки других лайнеров, а также сотни тысяч жизней перевезенных ими бойцов.
Для возврата на трансатлантические линии судну требовался капитальный ремонт и переборка всех машин и механизмов. Интенсивная эксплуатация в военные годы давала себя знать. Спустя десять дней после церемонии демобилизации лайнер встал на ремонт в Саутхемптоне. Работы продолжались десять месяцев, в них было занято более 4000 рабочих и персонала. Из Сиднея были доставлены все предметы интерьера лайнера, хранившиеся там с начала войны. Ремонт скрыл все шрамы, нанесенные внешнему облику и конструкции «Королевы» в войну: в частности, пришлось заменить практически все деревянное палубное покрытие. На судне оборудовали кинотеатр на 200 мест. Летом 1947 г. «Королева» вернулась к мирному труду на Атлантике, вновь став одним из самых красивых и комфортабельных судов, когда-либо ходивших по трассе Европа — Америка. Уровень роскоши и комфорта «Мэри» и «Элизабет» (после гибели «Нормандии») стал эталоном для всех конкурировавших с ними новых лайнеров.
Ежегодно обе «Королевы» перевозили через Атлантику более 150 тыс. человек. Так продолжалось два десятка лет, пока не были созданы межконтинентальные надежные авиалайнеры, сделавшие путешествие через Атлантику делом нескольких часов, а не дней, и, главное — снизивших стоимость такого путешествия. В связи с этим линейное пассажирское судоходство во всем мире начало приходить в упадок. Ведущие пароходные компании стали избавляться от больших неэкономичных судов, дальнейшая эксплуатация которых сулила лишь убытки.