24.09.1944 г. I-26 (Восьмая эскадра ПЛ) пришла в Йокосуку. I-53 (15-й ДПЛ) пришла в Сасебо после патрулирования в центральной части Тихого океана.
25.09.1944 г. Ro-47 (11-я эскадра ПЛ) была потоплена на подходах к о. Яп американским эскортным миноносцем Мс Соу Reynolds. Ro-113 (11-я зскадра) пришла в Пенанг.
26.09.1944 г. I-8 (Восьмая эскадра ПЛ) вышла из Пенанга и направилась в Индийский океан для борьбы с судоходством союзников.
30.09.1944 г. Флоту была передана Ro-55, которая вошла в состав 11-й эскадры ПЛ, перешла в Куре и приступила к боевой подготовке.
1.10.1944 г. I-365 (Седьмая эскадра ПЛ) разгрузилась у одного их о-вов Палау и направилась в Куре. I-44 (15-й ДПЛ) вышла из Иокосуки и направились в район к востоку от о-вов Палау для борьбы с боевыми кораблями союзников.
2.10.1944 г. Флоту была передана I-371, которая вошла в состав Седьмой эскадры ПЛ, перешла в Куре и приступила к боевой подготовке. Ro-115 (11-я эскадра) пришла в Сингапур.
3.10.1944 г. I-177 (12-й ДПЛ) была потоплена на подходах к о. Палау американским эскортным миноносцем Samuel S. Miles. Ro-41 (11-я эскадра ПЛ, капитан-лейтенант Сиидзука) у о. Моротай атаковала американское соединение из эскортных АВ Fanshan Вау и Midway в охранении четырех эскортных миноносцев. Из четырех выпущенных торпед одна попала в эскортный миноносец Shelton, и он вскоре затонул. Три оставшихся миноносца ошибочно потопили американскую ПЛ Seawolf, а Ro-41 благополучно ушла от преследования. Ro-115 (11-я эскадра) вышла из Сингапура и направилась к о. Цейлон для борьбы с судоходством союзников.
6.10.1944 г. I-41 (15-й ДПЛ) и I-45 (11-я эскадра ПЛ) вышли из Йокосуки и направились в район к востоку от Филиппинских о-вов для борьбы с судоходством союзников.
8.10.1944 г. Командующий Шестым флотом получил приказ сформировать соединение ПЛ, призванное, в случае необходимости, оказать поддержку Объединенному флоту при обороне Филиппинских о-вов.
Деятельность японских ПЛ в период проведения боев за Филиппинские о-ва
Получив приказ МГШ о создании соединения ПЛ, призванного оказывать поддержку Объединенному флоту в ходе обороны Филиппин, командующий Шестым флотом был вынужден включить в него практически все, имеемые у него на тот момент, боеспособные корабли. Были отозваны I-38, I-53, I-54 и I-56 (15-й ДПЛ), занимавшиеся подготовкой к использованию человекоуправляемых торпед. I-26 (Восьмая эскадра ПЛ), I-38, I-44, I-53, I-54 и I-56 (15-й ДПЛ), Ro-43 и I-46 (11-я эскадра ПЛ), Ro-46 (34-й ДПЛ) и Ro-109 (51-й ДПЛ) привели в боеготовое состояние. Находившимся в море I-45 и Ro-41 (11-я эскадра ПЛ), Ro-112 (30-й ДПЛ) и I-41 (15-й ДПЛ) приказали следовать в район к юго-востоку от о. Моротай. Если противник до конца октября не предпринял бы атаки Филиппин, последние корабли должны были заменить I-47 и I-48 (15-й ДПЛ), I-12 (Шестой флот) и Ro-55 (11-я эскадра ПЛ). До января 1945 г. им удалось потопить эскортный миноносец, повредить танкодесантное судно, эскортный АВ Santee и ЛКР Reno, потеряв при этом, только в октябре, четыре корабля.
9.10.1944 г. Флоту была передана I-369, которая вошла в состав Седьмой эскадры ПЛ, перешла в Куре и приступила к боевой подготовке.
11.10.1944 г. I-365 (Седьмая эскадра ПЛ) пришла в Куре. I-45 и Ro-41 (11-я эскадра ПЛ), Ro-112 (30-й ДПЛ) и I-41 (15-й ДПЛ) сосредоточились в районе к востоку от Филиппин.
13.10.1944 г. I-26 (Восьмая эскадра ПЛ) вышла из Йокосуки, а I-46 (11-я эскадра ПЛ) — из Куре, и они направились в район к востоку от пролива Суригао.
16.10.1944 г. I-54 и I-56 (15-й ДПЛ), Ro-43 (11-я эскадра ПЛ), Ro-46 (34-й ДПЛ) и Ro-109 (51-й ДПЛ) вышли из Куре (или Йокосуки) и направились в район к востоку от Филиппин. Ro-41 (11-я эскадра ПЛ) пришла в Куре после патрулирования в центральной части Тихого океана.
19.10.1944 г. I-365 (Седьмая эскадра ПЛ) вышла из Куре и направилась к атоллу Улити для попытки эвакуировать остатки гарнизона острова. Ro-113 (11-я эскадра) вышла из Пенанга и направилась в Бенгальский залив для борьбы с судоходством союзников.
21.10.1944 г. I-365 (Седьмая эскадра ПЛ) пришла в Куре, не выполнив задачи ввиду складывавшейся военной обстановки.
23.10.1944 г. I-54 (15-й ДПЛ) была потоплена в 70 милях к востоку от пролива Суригао американским эскортным миноносцем Richard М. Rowell при попытке атаковать КОН. I-46 (11-я эскадра ПЛ) атаковала американский КОН и повредила одно из судов типа LST.
24.10.1944 г. I-56 (15-й ДПЛ) к востоку от о. Лейте обнаружила и атаковала американский КОН. Из четырех выпущенных торпед одна попала в АВ Santee (был переоборудован из ТН). Корабль лишился хода, возник пожар в ангаре, погибло 16 человек. АВ вышел из боя и направился к атоллу Улити для ремонта.
27.10.1944 г. I-46 (11-я эскадра ПЛ) была обнаружена в надводном положении американским палубным самолетом к востоку от о. Лейте. Он навел на ПЛ ЭМ Неlm и Gridley, которые потопили ее.
28.10.1944 г. I-45 (11-я эскадра ПЛ, капитан-лейтенант Кавасима) в 100 милях к востоку от о. Лейте атаковала американское соединение эскортных АВ. Из шести выпущенных торпед одна попала в эскортный миноносец Eversole, и он вскоре затонул. Остальные корабли охранения начали преследование ПЛ и, по-видимому, в 125 милях к северо-востоку от о. Лейте, обнаружили I-26 (Восьмая эскадра ПЛ), которую глубинными бомбами потопили американские ЭМ Неlm и Gridley. I-45, избежав каких либо повреждений, продолжила патрулирование. I-26 не вышла на связь со штабом Шестого флота, и ее сочли пропавшей без вести.
29.10.1944 г. I-45 (11-я эскадра ПЛ) в 120 милях к востоку от пролива Суригао потопил американский ЭМ Whitehurst.
30.10.1944 г. I-12 (Шестой флот) пришла на атолл Трук после патрулирования в центральной части Тихого океана. I-365 (7-я эскадра ПЛ) вышла из Куре и направилась к атоллу Трук, имея на борту 60 т продовольствия.
2.11.1944 г. I-38 (15-й ДПЛ) вышла из Сасебо и направилась к Каролинским о-вам для борьбы с судоходством союзников.
3.11.1944 г. I-41 (15-й ДПЛ) к востоку от Филиппин атаковала и одной торпедой тяжело повредила ЛКР Reno. Корабль утратил боеспособность и был отбуксирован на атолл Улити. Ro-115 (11-я эскадра ПЛ) пришла в Пенанг после патрулирования у о. Цейлон. I-36, I-37 и I-47 (15-й ДПЛ) вышли из Сасебо и направились в Токуяма (на юго-западе о. Хонсю) для приема человекоуправляемых торпед. I-56 (15-й ДПЛ) пришла в Куре после патрулирования у Филиппинских о-вов.
5.11.1944 г. Ro-113 (11-я эскадра ПЛ, лейтенант Харада) в Бенгальском заливе потопила английское торговое судно (3827 т). I-36, I-37 и I-47 (15-й ДПЛ) пришли в Токуяма. Ro-112 (30-й ДПЛ) пришла в Йокосуку после патрулирования у Филиппинских о-вов.