Медицинская канцелярия в 1763 г. была реорганизована по образу и подобию других коллегий, получив название Медицинской коллегии. В 1804 г. с учреждением министерств Медицинская коллегия вошла в состав Министерства внутренних дел как Экспедиция государственной медицинской управы.
Аптекарский остров
Созданной в 1712 г. Аптекарской канцелярии и учрежденной при ней Главной аптеке в полное распоряжение передали целый остров. Он располагался в северной части дельты Невы и имел площадь около 2 гектаров. Называли его по-разному – Корписаари, что по-фински означает Остров глухого леса, Еловый, Дикий, но наиболее распространенным к тому времени было название Вороний остров. Этот остров сыграл важную роль в обороне Петербурга. Здесь, в районе нынешней Песочной набережной, в июне 1704 г. русские войска под командованием Романа Брюса дали достойный отпор шведам, которые вели наступление со стороны Каменного острова.
На острове стали размещаться хозяйственные объекты Аптекарского приказа и Главной аптеки, а указом 11 февраля 1713 г. государь повелел разбить в юго-восточной части острова Аптекарский огород для выращивания лекарственных трав, потребных армии и флоту.
К 1714 г. остров уже стали называть Аптекарским, а на его высоком песчаном берегу располагалось иноверческое кладбище, поскольку значительную часть служащих медицинского ведомства в то время составляли немцы, которые хоронили здесь своих соотечественников. При этом возникали проблемы, так как, по словам современника,
«часто их снова выкапывают из-за савана, грабят и так бросают, пока кого-то опять будут хоронить или же (возможно, спустя долгое время) родственники об этом не узнают и им придется еще раз погребать тело. По этой причине некоторые немцы хоронят своих мертвых на своих дворах, особенно детей, а тот, кто располагает средствами, выставляет на некоторое время собственную охрану в Аптекарском саду до тех пор, пока не сочтет, что о покойнике с его саваном забыли… Воры через два дня после похорон хотели выкопать тело немецкого придворного музыканта и уже разломали заступами и другими орудиями в земле гроб, но, поскольку они неправильно ухватились за тело, намереваясь вытащить его за ноги, то не успели управиться с работой и удалились. Утром люди увидели торчащие из могилы ноги, и некоторые старые русские женщины определенно подумали, что мертвые хотят воскреснуть».
В 1719 г. рядом с Аптекарским огородом Аптекарская канцелярия построила «Инструментальную избу» – мастерскую для изготовления медицинских инструментов (ныне Завод медицинских инструментов). На острове возникла Аптекарская слобода, где селились только служители и работные люди Медицинской канцелярии, учрежденной в 1721 г. взамен Аптекарской канцелярии. В слободе, кроме русских, проживали также немцы, голландцы и французы, нанятые на службу в Медицинскую канцелярию. Все проживавшие на Аптекарском острове подчинялись начальнику Медицинской канцелярии, являвшемуся смотрителем острова. Без его разрешения жителям запрещалось покидать остров, а также заключать браки. Однако это не помешало в 1718 г. без ведома смотрителя открыть на острове торговую баню и кабак.
К 1721 г. Аптекарским огородом, который вскоре стал именоваться Медицинским садом, изготавливалось около 160 наименований лекарств и лечебных препаратов, кроме того, здесь варили пиво, входившее в качестве противоцинготного средства во флотский рацион.
Посетивший в 1726 г. Аптекарский остров французский путешественник Обри де ла Мотре писал:
«Медицинский сад весьма богат не только теми растениями, какие можно найти и какие известны в западной, восточной и южной частях Европы, но даже растущими в более северных ее частях, открытыми благодаря поощрению, содействию, какие оказывал Петр I приглашенным им способным ботаникам; также еще и растениям с наиболее отдаленных берегов Азии, Персии и Китая; они, в том числе названные последними, чувствуют себя словно в своем естественном климате. Ананасы растут здесь до созревания, их снимают и подают на стол. (Все это обязано большому искусству.) Об этом участке и том месте, где стоят пивоварни и склады, я должен сказать, что они менее всего обижены природой, а кроме того, являются самыми высокими местами в окрестностях Петербурга и, следовательно, наименее подвержены наводнениям. В нижней части этого сада, к юго-западу, находится аптекарский дом, дающий имя острову; это довольно хорошее здание, в нем хранится множество всевозможных лекарств… Остров настолько велик, что даже обширный сад занимает не более чем его маленький уголок».
Неподалеку от Медицинского сада, напротив нынешней улицы Льва Толстого, на острове с 1732 г. было место для выпаса скота и лошадей с подворья епископа Феофана Прокоповича. Сам епископ любил прогуливаться по Медицинскому саду. Остальная, большая часть Аптекарского острова была покрыта еловым лесом.
Посетивший в царствование императрицы Анны Иоанновны Петербург датский путешественник Педер фон Хавен писал: «Особенность этого Аптекарского острова и сада, наряду с местоположением, такова, что на протяжении всего лета это самое приятное и веселое место во всем Петербурге. Посему туда ежедневно плавают на судах развлекаться прогулками многие из знати».
Впрочем, называть это место «веселым» можно с большой натяжкой. Тот же Хавен далее писал:
«Одно из мест, где в Петербурге производится казнь, тоже находится на Аптекарском острове… Преступника обычно сопровождает к месту казни капрал с пятью-шестью солдатами, священник с двумя маленькими одетыми в белое мальчиками, несущими по кадилу, а также лишь несколько старых женщин и детей, желающие поглядеть на сие действо… Как только пришедший с ними судебный чиновник зачтет приговор, священник осеняет осужденного крестом, осужденный сам тоже несколько раз крестится со словами „Господи, помилуй“, и затем несчастный грешник предает себя в руки палача и так радостно идет навстречу смерти, словно бы на великий праздник. Палач, являющийся в сем действе главной персоной, часто исполняет свои обязанности очень неторопливо и жалостливо, как плохая кухонная девушка режет теленка. Вообще же достойно величайшего удивления то, что, как говорят, никогда не слыхали и не видали, чтобы русский человек перед смертью обнаруживал тревогу и печаль. Это, без сомнения, отчасти объясняется их верой в земное предопределение и его неизбежность, а отчасти – твердым убеждением, что все русские обретут блаженство, и, наконец, отчасти великими тяготами, в которых они живут в сем мире».
В 1735 г. Медицинский сад возглавил приглашенный немецкий ботаник и врач И. Сигизбек. С этого времени здесь занимались научными исследованиями, а также подготовкой и переподготовкой фармацевтов. Был издан каталог растений Медицинского сада, в который включили 1275 видов произраставших здесь растений. Но главной задачей сада осталось производство лекарств. Для расширения их ассортимента на острове попытались создать заячий питомник. В то время считалось, что лодыжки и сало этих животных обладают необычайными лечебными свойствами. Специальным указом крестьянам Псковской, Новгородской и Петербургской губерний повелевалось поставлять на Аптекарский остров живых зайцев. Затея эта успеха не имела, так как местные жители нещадно истребляли «косых», а при наступлении морозов зайцы разбегались с острова.