Конфликт Правительства с атаманом Семеновым не мог не отразиться на работе съезда. Сторонники атамана надеялись на то, что съезд обеспечит поддержку идее вооруженного противостояния с ДВР. Незамедлительной поддержки военных действий требовали «семеновцы». В информационной сводке, составленной ими после окончания работы Съезда, отмечалось: «Приморцы-меркуловцы стояли за прекращение гражданской войны, прекращение вооруженной борьбы с большевиками. Их идеология сводилась к тому, что гражданская война изжита, что нужно создать хорошие экономические условия для населения и тогда, будто бы, соседние области из зависти к хорошей жизни приморцев сбросят у себя большевиков сами, что надо пропагандировать у соседей взрыва изнутри, а не освобождать их силой, что всякая армия обуза и должна быть распущена, что Приморье защищается интервентами и за их барьер залезать не нужно, – и таким образом Атаман, как «беспокойный» элемент идет будто бы вразрез с «объективной» обстановкой.
В то же время «активисты, сторонники Атамана, стояли на точке зрения необходимости объединить армию и дать ей возможность поддержать из Приморья вооруженной силой движения барона Унгерна в Забайкалье и атамана Амурского казачьего войска Сычева в Амурской области. Активисты считали, что раз антибольшевистское движение идет под знаком добровольчества и никаких мобилизаций не предвидится, то нельзя запрещать добровольцам сражаться за освобождение Родины и нельзя их лишить признаваемого ими главы их Атамана Семенова и не использовать Приморья как территориальной базы для борьбы». Однозначно утверждалось, что «вся обстановка на Дальнем Востоке за последнее время с очевидностью показывает, что борьба с большевизмом далеко не изжита, что никакое соглашательство с Дальневосточной республикой ни к каким позитивным результатам привести не может, а поведет лишь к окончательному краху антибольшевистского движения… Вся сумма сведений о боевой подготовке красных на Дальнем Востоке против антибольшевистских сил настойчиво указывает на настоятельную необходимость скорейшего объединения всех антибольшевистских групп и на скорейшую их организацию для вполне планомерных и согласованных действий под одним общим командованием».
Но в результате, по мнению авторов сводки, «Правительство добилось своего. Психология «непротивления»… победила. Была вынесена бездарная, пацифистская, безыдейная, обезличивающая съезд резолюция, в которой ни слова не говорилось о борьбе и в которой съезд превратился из активного центра национальной борьбы в подсобное правительству агитационное учреждение. Активисты были побеждены, но не духовно, а задавлены массой, стадным, «шкурным» большинством. Атаман Семенов не получил возможности при посредстве съезда подойти к участию в национальной борьбе, правительство пока победило, но более всего пострадало оно само».
До конца работы съезда «семеновцы» не доработали: демонстративно покинули заседания представители амурского казачества, и еще около 30 других делегатов, сторонников атамана и крайне правые. При этом казаки-«приморцы» были вполне лояльны к Правительству.
Важное значение имело отношение крестьянства. Но если Всероссийский Крестьянский Союз, поддерживавший Семенова, фактически вошел в состав харбинского Русского Национально-Экономического Объединения и утратил «прямое» влияние на Владивосток, то проведенный 15–17 июня 1921 г. Съезд представителей сельских сходов Приморья заявил о непризнании полномочий Семенова и о своей поддержке правительственного курса лишь в том случае, если власть будет опираться на созванное Народное собрание, органам местного самоуправления будут гарантированы широкие полномочия, а правительство будет стремиться к сохранению «гражданского мира». Участие в работе Несоциалистического съезда оговаривалось условиями его «демократизации» («Несоциалистический съезд как таковой не является выразителем воли народа, как воли большинства, так как в нем не представлены широкие слои населения») и обязательного проведения выборов в новое Народное Собрание.
В Никольск-Уссурийском уезде проходили выборы делегатов на съезд на сельских сходах, и это, несомненно, укрепляло правительственные позиции среди местного населения, а во Владивостоке, на основе крестьянской фракции бывшего Народного Собрания, был образован новый Крестьянский Союз. В конфликте с атаманом Семеновым крестьяне, вместе с поддержавшими их представителями Уссурийского Войскового правления и делегатами от Полтавского станичного округа, приняли резолюцию, гласившую, что «не только власть атамана Семенова, но и пребывание его в Приморье и на всей русской территории вновь пробуждает в народе воспоминание о кровавой деятельности его и его сподвижников, временах пыток, расстрелов и народных страданиях. Нет и не может быть возврата к диктатуре групп и отдельных лиц, противопоставляющих свою волю воле народа».
Далее отмечалось: «С момента Созыва Учредительного Съезда верховная власть должна принадлежать только ему» (то есть Правительство должно подчиниться представительной власти), а «гарантией созыва Народного Собрания 7 июля и созыва Учредительного Съезда 1 сентября нам будет служить Каппелевская Армия». После оглашения данной резолюции представители крестьянской группы покинули заседания съезда, заявив о подготовке к участию в выборах Народного Собрания. Аналогичную позицию бойкота съезда заняли профсоюзы Приморья, за исключением представителей профсоюза Амурского судоходства и отдельных рабочих коллективов (паровозные бригады депо Никольска-Уссурийского, Общество русских тружеников печатного дела).
В итоге съезд принял оглашенную Председателем Совета съезда Н. Андрушкевичем резолюцию, в которой ясно говорилось, что действия атамана Семенова «являются актом неповиновения законной русской власти края», «попытка атамана Семенова поставить свою волю выше всех слоев населения, неоднократно ясно выраженной, является преступной», «стремление атамана Семенова, не обладающего ни средствами, ни сочувствием населения, начать немедленно вооруженную борьбу с большевиками – обречено на явную гибель», «вся деятельность атамана Семенова при подобных обстоятельствах является вредной для общего русского национального дела». Исходя из этого «Совет съезда приглашает граждан к спокойной творческой работе и выражает твердую уверенность, что Временное Правительство принимает все меры как к воссозданию здоровой мирной жизни края, так и для борьбы с анархией, откуда бы эта анархия ни исходила (даже со стороны преемника власти Колчака. – В.Ц.)».
Сам глава приамурской власти С. Д. Меркулов трижды выступал на его совещаниях. Им был сделан закрытый доклад, характеризующий сложное финансовое положение в крае. В выступлении 17 июня он отметил, в частности, что вопрос о «майском перевороте» был решен «еще до открытия первой сессии Несоциалистического съезда, и тогда же каппелевское командование предложило группе Меркулова свою поддержку. Когда на съезде выбирали Совет, знали, что выбирают будущее правительство».
В заключительной речи при закрытии съезда, 25 июня, он говорил: «Если первая сессия, совершившая огромное дело по сплочению несоциалистического населения, дала в результате существующее Правительство, то вторая сессия, насчитывающая в своем составе значительно большее количество организаций, чем в первой сессии, с достаточной очевидностью показала, что дело Возрождения Родины дорого очень и очень многим. Новые организации влились в наш съезд, и общее великое дело имеет теперь за собой уже достаточно прочную и верную опору. Несоциалистический съезд представляет огромную массу, являющую собой население и отражающую его интересы. Старания оппозиционных газет опорочить съезд ни к чему не привели».