Утром 14 октября в 12 милях юга-западнее Мемеля «Щ-407» обнаружила корабли 2-й Боевой группы противника (крейсера «Лютцов» и «Принц Евгений», 3 эсминца, 4 миноносца), следующих для поддержки своих войск на полуострове Сырве. Из-за высокой скорости целей выйти в атаку подводная лодка не смогла. Спустя несколько часов «Щ-407» атаковала транспорт из состава конвоя. Торпеды прошли мимо канонерской лодки «LAT-24». В ответ эскорт почти час бомбил подводную лодку, сбросив на нее 155 глубинных бомб.
17 октября «Щ-407» получила разрешение командования на возвращение на базу. Утром 20 октября у острова Утё подводная лодка была встречена тральщиком и сопровождена в пролив Юнгфрунзунд. Поскольку договоренности с финнами о ремонте советских кораблей на финских верфях еще не было, подводная лодка направилась в Кронштадт, где прошла межпоходовый ремонт и докование.
Следующий выход в море «Щ-407» пришелся на 24 ноября. В этот день она вышла Лавенсари и направилась на Ханко. Вечером 28 ноября в районе Утё «Щ-407» погрузилась и направилась в северную часть Данцигской бухты (позиция № 5). В ночь на 2 декабря подводная лодка прибыла в район действий. Командир субмарины решил произвести самостоятельный поиск. Днем «Щ-407» в подводном положении прошла вдоль северного побережья косы Хель и проникла в Пуцкий залив. Опасность замысла заключалась в том, что в этом районе противник обладал значительными силами ПЛО, в дополнение к этому район активно минировался британской авиацией. Днем 4 декабря в 36 кбт южнее маяка Хейстернест подводная лодка обнаружила крупное судно, стоящее на якоре. Две выпущенные торпеды попали в цель. Спустя пять минут командир «Щ-407» мог видеть гибель транспорта. Жертвой торпед подводной лодки стал теплоход «Зеебург» (12 181 брт.), за два дня до этого подорвавшийся на британской мине. Судно использовалось в качестве корабля-цели для тренировок германских подводников. Следует отметить, что «Зеебург» стал третьим по водоизмещению транспортом (после «В. Густлова» и «Штойбена»), потопленным советскими подводниками в годы войны. Преследования не было, и подводная лодка без труда покинула место катастрофы. При выходе из залива «Щ-407» намотала на левый гребной вал кусок противолодочной сети. Освободиться от него своими силами экипаж подводной лодки не сумел. Вал пришлось остановить. Утром 5 декабря в 9 милях юго-западнее Пиллау субмарина выпустила 3 торпеды по одиночному транспорту, но промахнулась. Продолжать поход с такой неисправностью подводная лодка не могла и вечером 6 декабря была отозвана на базу. В ночь на 11 декабря «Щ-407» прибыла в Турку, где прошла доковый ремонт.
Днем 12 января 1945 года «Щ-407» вышла в район северо-западнее маяка Брюстерорт (позиция № 3). Погода и активизация сил ПЛО противника не способствовали удачному патрулированию. В ночь на 16 января подводная лодка заняла указанный район. Возможность атаковать представилась тем же вечером. Суда конвоя без труда уклонились от трех торпед, выпущенных подводной лодкой в условиях 6-балльного шторма (сопровождавший суда сторожевик «V-1704» наблюдал след двух торпед). Четвертая торпеда, приготовленная к пуску, не вышла из торпедного аппарата и выпала при дифферентовке спустя три часа после атаки. Подводная лодка продолжала оставаться на позиции, которая была несколько расширена до меридиана маяка Риксгафт. Возможность пополнить счет представилась только вечером 12 февраля, но суда конвоя уклонились от трех выпущенных подводной лодкой торпед. (Их след наблюдал торпедолов «TS-8».) Четвертая торпеда, подготовленная к пуску, снова не вышла из торпедного аппарата. Корабли эскорта конвоя сбросили на «Щ-407» 9 глубинных бомб, подводная лодка получила незначительные повреждения.
Израсходовав топливо, продовольствие и торпеды в носовых торпедных аппаратах, «Щ-407» вечером 17 февраля начала возвращение на базу и 21 февраля прибыла в Турку, где встала на межпоходовый ремонт.
19 апреля «Щ-407» вновь вышла в море для патрулирования в районе острова Борнхольм, но ничего, кроме шведских дозоров, не обнаружила. После подписания акта о капитуляции Германии подводная лодка получила приказ о возвращении на базу и вечером 13 мая прибыла в Турку. На этом участие «Щ-407» в боевых действиях подошло к концу.
9 июня 1949 года подводная лодка получила обозначение «С-407». 17 февраля 1956 года она была выведена из боевого состава и обращена в опытовую подводную лодку, а 19 января 1959 года субмарина исключена из списков ВМФ, расформирована и впоследствии разделана на металл в Лиепае.
5 боевых походов:
12.08.1942-28.09.1942.
28.09.1944-21.10.1944.
24.11.1944-11.12.1944.
12.01.1945-21.02.1945.
19.04.1945-13.05.1945.
10 торпедных атак (выпущено 23 торпеды). Потоплено 2 судна (13 308 брт.): «Нордштерн» (1127 брт., 06.10.1944) и «Зеебург» (12 181 брт., 04.12.1944).
Щ-408 X-БИС СЕРИЯ
Заложена 23 апреля 1939 года на заводе № 194 (им. Марти) в Ленинграде и 4 июня 1940 года спущена на воду. Начало Великой Отечественной войны подводная лодка встретила под командованием капитан-лейтенанта Кузьмина Павла Семеновича в составе учебной бригады ПЛ КБФ в Кронштадте. На корабле подходили к концу монтажные работы. Степень технической готовности субмарины составляла 80–82,7 %. 10 сентября 1941 года «Щ-408» вступила в строй и 22 сентября вошла в состав Краснознаменного Балтийского флота.
26 сентября 1941 года при переходе из Кронштадта в Ленинград лодка столкнулась в Морском канале с сетевым заградителем «Онега». В результате аварии на подводной лодке пробит прочный корпус, погнута тумба перископов. Субмарина была вынуждена вернуться на завод и встать на ремонт.
22 июня 1942 года, когда лодка стояла у стенки завода № 194, она вновь была повреждена в результате попадания двух снарядов. Через образовавшиеся пробоины внутрь корабля поступила вода. 5-й отсек был затоплен. Второй снаряд нанес повреждения в надстройке. Кораблю снова потребовался ремонт.
16 октября «Щ-408» перешла в Кронштадт. 25 октября у борта лодки взорвался 210-мм снаряд. Субмарина вновь получила 2 осколочные пробоины в прочном корпусе. 5 членов экипажа субмарины были ранены.
В свой первый боевой поход лодка вышла только 7 мая 1943 года. 18 мая она покинула Лавенсари. При форсировании Нарген-Поркалаудского заграждения «Щ-408» 19 мая была обнаружена, обстреляна и повреждена немецким самолетом, а 22 мая она по масляному следу обнаружена в районе острова Вайндло силами ПЛО противника и подверглась преследованию пяти противолодочных катеров. Утром 22 мая с лодки поступило донесение с просьбой о помощи. Вылетевшие с Лавенсари на помощь «Щ-408» восемь истребителей И-16 и И-153, потеряв две машины, вернулись на аэродром, не выполнив задачи. Так как это были последние самолеты на острове, командир базы не хотел ими рисковать. Только спустя 8 часов на помощь лодке командование ВВС КБФ выслало десять Ла-5, но и они, потеряв два самолета, не добились успеха.
К тому времени, когда через 20 часов к лодке были посланы достаточные силы, «Щ-408» вынуждена была всплыть и принять артиллерийский бой с кораблями противника.
