В ночь на 15 августа «М-96» перешла в район Палдиски, где обнаружила конвой противника, но ввиду малой ценности целей командир от атаки отказался. 19 августа, израсходовав топливо, субмарина направилась на базу, не известив об этом командование. Вечером 22 августа в районе Лавенсари подводная лодка подверглась преследованию своих сторожевых катеров. К счастью, все обошлось, и 25 августа «М-96» благополучно ошвартовалась в Кронштадте.
В следующий боевой поход «М-96» вышла 4 ноября 1942 года. На борту субмарины находилась разведгруппа из пяти человек, задачей которой был налет на немецкий радиопост и захват шифровальной машинки «Энигма». (По воспоминаниям П. Д. Грищенко, с сентября 1943 года служившего в разведотделе штаба КБФ, эта операция проведена в начале декабря 1943 года.) Командовал разведчиками старший лейтенант М. С. Калинин, помощник командира «Щ-303», впоследствии командир ПЛ «Щ-307», Герой Советского Союза. Разведчики также были набраны из экипажа «Ерша». Вечером 11 ноября разведгруппа высажена в районе Нарвы. Переодетые в немецкую форму разведчики Суздальцев и Охлопков добыли «языка», но после его допроса выяснилось, что необходимой информацией он не владеет. Совершив налет на штаб полка, разведчики захватили документы и пленного (Грищенко говорит о двух пленных), но «Энигмы» не обнаружили. При возвращении разведгруппы на подводную лодку шлюпка с людьми перевернулась, трое разведчиков и захваченный ими пленный утонули. Приняв на борт оставшихся в живых, подводная лодка вернулась в Кронштадт.
В марте 1943 года командиром лодки назначен капитан-лейтенант Карташов Николай. Иванович, а Маринеско принял «С-13».
В 1943 году «М-96» совершила два похода. Так как противник создал в Финском заливе мощные противолодочные заграждения, «малютки» действовали на мелководье, занимаясь визуальной разведкой.
Первый поход с новым командиром прошел не совсем гладко. 19 июля 1943 года в районе банки Туолюла подлодка села на мель, повредив винт, ограждения рулей и корпус. Выполнив задачу по разведке района Хапасарских шхер, в ночь на 21 июля «М-96» прибыла на Лавенсари, а затем перешла в Кронштадт, где была поставлена в док.
Второй поход кампании 1943 года проходил в районе острова Гогланд. Днем 28 августа субмарина прибыла на позицию, и на следующую ночь высадила на Гогланде группу разведчиков. 30 августа «М-96» сместилась к маяку Тийскери, где неоднократно обнаруживала сторожевые катера противника. В ночь на 1 сентября подводная лодка высадила на Гогланде вторую разведгруппу, после чего направилась на базу.
Кампанию 1944 года «М-96» начала 18 июня. Подводная лодка перешла по Неве в Ладожское озеро, где сделала один поход к острову Валаам в целях разведки и прикрытия десанта войск Карельского фронта у Тулоксы. 13 июля лодка возвратилась в Ленинград.
18 августа 1944 года, при выходе в боевой поход, «М-96» легла на грунт в ожидании сумерек. Начался шторм, в результате удара о грунт лодка повредила киль, и ей пришлось вернуться в Кронштадт на ремонт.
В свой последний боевой поход с задачей разведки минных заграждений в Нарвском заливе «М-96» вышла 7 сентября 1944 года. На борту субмарины в качестве обеспечивающего в море вышел оператор бригады ПЛ капитан 2-го ранга Н. Н. Бутышкин. Назад лодка не вернулась. Вероятно, «М-96» погибла, подорвавшись на мине заграждения «Зееигель» в Нарвском заливе 7–9 сентября 1944 года. Вместе с «М-96» на дне покоятся 22 члена экипажа субмарины.
7 боевых походов:
22.07.1941-29.07.1941.
12.08.1942-25.08.1942.
08.11.1942-12.11.1942.
18.07.1943-21.07.1943.
28.08.1943-03.09.1943.
22.06.1944-29.06.1944.
07.09.1944 — из похода не вернулась.
1 безуспешная торпедная атака с выпуском 1 торпеды.
М-97 XII СЕРИЯ
Заложена 26 июля 1937 года на заводе № 112 (Красное Сормово) в Горьком под строительным номером С.249. В мае 1939 года командиром корабля назначен П. М. Шалаев. 20 сентября «М-97» была спущена на воду. 10 октября 1939 года подводная лодка вступила в строй, после чего она вместе с «М-96» была поставлена в плавдок для транспортировки на Балтику, но их отправка не состоялась, и субмарины остались зимовать на Волге. 12 ноября 1939 года «М-97» вошла в состав Краснознаменного Балтийского флота, но на Балтику подводная лодка прибыла только весной 1940 года.
22 июня 1941 года «М-97» встретила под командованием капитан-лейтенанта Мыльникова Александра Ивановича, который командовал кораблем с октября 1939 года в составе 8-го дивизиона 2-й бригады ПЛ КБФ. Субмарина находилась в текущем ремонте в Таллине и числилась в первой линии. Уже 26 июня при пробном выходе после ремонта подводная лодка подверглась безуспешной атаке вражеского самолета.
4 июля подводная лодка перешла в Палдиски, откуда вечером 6 июля совместно с «М-103» в сопровождении двух БТЩ и двух СКА вышла в дозор к острову Утё (позиция № 7). В ночь на 7 июля на меридиане маяка Тахкуна сопровождавший субмарину «Т-216» подорвался на мине (время гибели корабля у М. Морозова — 23.25; у А. Платонова — 12.35, место гибели 59°09′5″ с.ш./22°37′5″ в.д.). Находившийся на борту тральщика командир 8-го дивизиона ПЛ капитан 3-го ранга Е. Г. Юнаков, обеспечивающий развертывание подводных лодок дивизиона, получил тяжелую контузию, но был подобран из воды сторожевым катером. Потеряв лидера эскорта (второй тральщик, «БТЩ-211», встретив возвращающуюся с позиции «М-102», повернул обратно); подводным лодкам пришлось вернуться в Палдиски, откуда «М-97» перешла в Триги, по пути подвергаясь неоднократным атакам вражеской авиации.
Утром 8 июля «М-97» вновь вышла на позицию. Днем, подвергшись атаке самолета противника, подводная лодка погрузилась и далее продолжила движение в подводном положении. 10 июля субмарина была в указанном районе (у острова Утё, позиция № 7). Возможность отличиться «М-97» представилась около полудня 11 июля, когда в перископе командир советской субмарины увидел «челнок» «U-144» (Мыльников оценил цель как подводную лодку типа «Ветехинен».) Условия для атаки были идеальные (курс цели 45°, свой курс — 0°, дистанция 6 кбт, которая в ходе наблюдения за целью сократилась до 2 кбт, ход цели 2–3 узла). К сожалению, командир забыл дать команду о подготовке торпедных аппаратов к залпу, и момент для пуска торпед был упущен. Спустя несколько часов роли поменялись, и командир «U-144» выпустил одну торпеду по «М-97», правда, также неудачно. В ночь на 14 июля подводные лодки встретились вновь. На этот раз в качестве потенциальной цели снова выступала «U-144», но командир «М-97» посчитал условия для проведения атаки невыполнимыми, и команды «Пли» не последовало. 14 июля «М-97» благополучно вернулась в Триги, а 8 августа перешла в Кронштадт.
В следующий боевой поход с задачей разведки в районе Таллина «М-97» вышла в ночь на 12 сентября. За все время нахождения на позиции встреч с противником подводная лодка не имела и в ночь на 19 сентября начала возвращение на базу. На переходе субмарина была трижды атакована финским самолетом «Бристоль-Бульдог» и легко повреждена пулеметным огнем. На исходе 20 сентября «М-97» ошвартовалась в Кронштадте.
