Утром 11 декабря «Лембит» произвел торпедную атаку по конвою. Через 35 секунд после пуска торпед на подводной лодке был услышан взрыв большой силы. На субмарине были повреждены легкий корпус и ограждение рубки, а вскоре обнаружилось сильное поступление воды в прочный корпус. Очевидно, торпеды взорвались вблизи подлодки, не дойдя до цели. После атаки «Лембит» провалился на глубину 62 м. Всплыв под перископ через 15 минут после атаки, командир посчитал атаку удавшейся, так как обнаружил отсутствие одного судна из состава конвоя. Вечером того же дня подводная лодка начала возвращение на базу. Днем 14 декабря западнее острова Утё (59°43′0″ с.ш./21°19′6″ в.д.), следуя в подводном положении, «Лембит» ударился о подводный предмет. Удар получился скользящий. Подводную лодку подбросило на 4 м, затем она сползла с неизвестного объекта. Немедленно всплыв, субмарина обнаружила на поверхности воды пятно соляра и деревянный решетчатый люк, и его обломки. У самой подводной лодки повреждения ограничились вмятиной на крышке торпедного аппарата правого борта. Первоначально командир «Лембита» посчитал, что таранил советскую подводную лодку, но после того, как выяснилось отсутствие советских субмарин в этом районе, инцидент был исчерпан. Во многих источниках жертвой подводного столкновения «Лембита» называют германскую подводную лодку «U-479», пропавшую без вести в Финском заливе в период после 15 ноября 1944 года. Присутствие «U-479» в этом районе спустя месяц после последнего полученного от нее сообщения исключено. Немецкая субмарина должна была действовать в районе острова Осмусаар и уже 12 декабря 1944 года была объявлена погибшей. Возможно, она погибла на советской мине передовой минной позиции, выставленной летом 1941 года, либо в результате аварии. Вероятнее всего, идя в подводном положении, «Лембит» столкнулся с корпусом затонувшего судна.
15 декабря подводная лодка прибыла в Турку, откуда на следующий день перешла в Хельсинки, где прошла доковый ремонт. 6 марта 1945 года Указом Президиума Верховного Совета СССР подводная лодка «Лембит» была награждена орденом Красного Знамени.
В следующий боевой поход «Лембит» вышел 23 марта 1945 года. Его путь лежал в район восточнее банки Штольпе (позиция № 4). До вечера 25 марта подводная лодка шла во льдах в сопровождении ледокола «Сису». При проводке субмарина получила легкие повреждения корпуса и дейдвудных сальников, в результате чего в трюм 5-го отсека начала поступать вода, создающая дифферентующий момент. Выйдя в точку погружения, подводная лодка продолжила движение самостоятельно и вечером 28 марта прибыла на позицию. Днем 30 марта «Лембит» выставил минное заграждение в 10 милях северо-восточнее маяка Риксгафт (5 банок по 4 мины, минный интервал 50 м, углубление 2,5 м). Через два часа после постановки мин в направлении минного заграждения были услышаны шум винтов, а затем три сильных взрыва. Еще один взрыв в районе заграждения на подводной лодке слышали 2 апреля. Причину этих взрывов объяснить непросто, так как подтвержденных данных об успехе этой постановки нет. Возможно, на этих минах погиб 25 апреля германский сторожевик «Vs-343», пропавший без вести в этом районе. Заявленные в качестве минных успехов «Лембита» сторожевик «Vs-1014» погиб на британской мине 18 марта 1945 года, сторожевик «Vs-301» потоплен советской авиацией в районе Пиллау 19 марта 1945 года, а большой охотник «Uj-1108» уничтожен в районе Берлевога советской подводной лодкой «К-3».
Повреждения, полученные подводной лодкой при выходе на позицию, были не единственными в этом походе «Лембита». Вскоре вышла из строя гидравлическая машинка вертикального руля. В районе банки Северная Средняя подводная лодка легла на грунт, но устранить неисправность экипаж так и не смог. 6 и 7 апреля подводная лодка имела ряд контактов с кораблями ПЛО противника, которые сбросили на безопасном удалении от «Лембита» 83 глубинных бомбы. Днем 7 апреля «Лембит» подвергся безуспешной атаке вражеской субмарины (противник не комментирует этот эпизод), а 9 апреля в районе маяка Хоборг была обнаружена противолодочными кораблями и полтора часа преследовалась ими (на подводную лодку сброшено 85 глубинных бомб). 10 апреля преследования возобновились. В этот момент на подводной лодке вышел из строя коллектор левого дизеля и компрессор воздуха высокого давления № 2. В ночь на 11 апреля ввиду аварийного состояния корабля командир принял решение возвращаться на базу. Утром 13 апреля в районе острова Нюхамн подводная лодка встречена ледоколом и утром следующего дня прибыла в Турку, где встала на ремонт. Здесь же подводники встретили известие об окончании войны.
17 января 1946 года «Лембит» выведен из боевого состава флота и переформирован в учебную подводную лодку. Субмарина была передана Краснознаменному учебному отряду подводного плавания им. Кирова. 18 июня 1946 года она получила обозначение «У-1», а с 12 января 1949 года стала называться «С-85». 10 июня 1955 года подводная лодка разоружена и переведена в категорию учебно-тренировочных станций. 30 января 1956 года ей было присвоено обозначение «СТЖ-24», а с 27 декабря 1956 года — «УТС-29».
3 августа 1957 года судно было передано в аренду заводу «Красное Сормово» в Горьком (Нижний Новгород). В 1977 году состоялось решение оставить подводную лодку как памятник. 28 августа 1979-го субмарину перевели в Таллин, и 5 мая 1985 года после восстановительного ремонта «Лембит» был установлен в качестве мемориала и филиала Музея ДКБФ в Пирите (Таллин).
27 апреля 1992 года четверо вооруженных лиц из комендантской роты штаба Сил Обороны Эстонской Республики проникли на площадку перед «Лембитом», взобрались на палубу, свинтили звездочку на рубке и подняли флаг Эстонии. Протесты российского командования ни к чему не привели, а после «вывода» российских армии и флота из Прибалтийских республик мемориал остался у эстонцев. Сейчас подводная лодка является филиалом морского музея Эстонской Республики.
7 боевых походов:
10.08.1941-21.08.1941.
19.10.1941-26.10.1941.
04.11.1941-05.11.1941.
18.08.1942-19.09.1942.
02.10.1944-18.10.1944.
24.11.1944-15.12.1944.
23.03.1945-14.04.1945.
8 торпедных атак (выпущено 14 торпед). Торпедами потоплен транспорт «Хильма Лоу» (2414 брт., 13.10.1944), транспорт «Финланд» поврежден (5281 брт., 14.09.1942) и спустя непродолжительное время после атаки затонул. Результат еще одной атаки неясен (15.10.1944), название атакованного судна неизвестно. 5 минных постановок (установлено 100 мин). На минах, возможно, погибли буксир «Пионер-5» (около 100 брт., 23.10.1944), рыболовный траулер «Шпрееуфер» (216 брт., 24.10.1944), всего 2 судна (ок. 300 брт.) и 2 корабля — тральщик «Поркалла» (28.11.1941) и СКР «Vs-343» (25.04.1945).
Л-55 (ДО 10 ДЕКАБРЯ 1932 г. «L-55»)
Бывшая британская лодка типа «L» III серии.
Заложена в 1917 году на судоверфи «Файрфельд Шипбилдинг энд Инженеринг Компани» в Глазго. Спущена на воду и вошла в строй в 1918 году. В 1919 году принимала участие в боевых действиях против РККФ в ходе Гражданской войны в России.
4 июня 1919 года «L-55» (командир капитан-лейтенант Чарлз Чапмен) двумя торпедами неудачно атаковала эсминцы «Азард» и «Гавриил» в Копорском заливе. После торпедного залпа лодку выбросило на поверхность, и она была обстреляна эсминцем «Азард». Погружаясь, субмарина навалилась левым привальным брусом на минреп одной из мин английского противолодочного заграждения, и притянутая к корпусу мина взорвалась в районе ходового мостика. Лодка погибла в месте с координатами: 59°55′ с.ш./28°46′06″ в.д. на глубине 32 метра. Никто из экипажа не спасся.
