С конца 1950-х годов Египет отдалился от западных стран и сблизился с СССР. Советскому Союзу было очень выгодно приобрести нового союзника на Ближнем Востоке. С этой целью СССР оказал Египту большую экономическую помощь, предоставив выгодные займы, также помог с постройкой Асуанской плотины, поставлял оружие и зерно.
В начале 1967 года в Израиле существовало мнение, что Египет вряд ли начнет полномасштабную войну. К весне 1967 года отношения между Египтом и Израилем были достаточно спокойные.
А вот отношения Израиля с Сирией были откровенно плохими. Постоянно происходили столкновения из-за водных ресурсов.
В 1965 году была образована Организация освобождения Палестины. Целью ее было расформирование «сионистского образования». Ведущее место в ней занимала военная организация Эль-Фатх, которая 2 января 1965 года совершила свою первую военную операцию против Израиля — нападение на израильский водопровод.
Всего с 1965-го по июнь 1967 года Эль-Фатх и другие военизированные группы совершили 122 нападения на Израиль, однако в большинстве случаев они были неудачны. Хотя бóльшая часть нападений происходила с ливанской и иорданской территории, вооружение, обучение и поддержку боевики получали в основном со стороны Сирии.
В ноябре 1966 года Сирия и Египет заключили союз. С апреля по май 1967 года происходит учащение боевых столкновений на границе Сирии и Израиля.
В своем выступлении в Кнессете в мае 1967 года премьер-министр Израиля Леви Эшколь возложил на Сирию ответственность за 113 инцидентов — подкладывание мин, диверсии. Кроме того, он обвинил Сирию в обстрелах израильских фермеров и населенных пунктов, не вызванных какой-либо военной необходимостью. Обстрелы велись с участием артиллерии.
С 1966 года Израилем было подано 34 протеста в СБ ООН. 7 апреля 1967 года, после обстрела с сирийской территории израильского фермера, израильтяне открыли ответный огонь. Этот инцидент привел к воздушному столкновению ВВС Израиля и Сирии. При этом было сбито шесть сирийских истребителей, в том числе два из них — прямо над Дамаском.
После этого началось наземное столкновение с участием танков. Министр информации Сирии заявил о том, что эта битва будет продолжена более серьезными сражениями, пока Палестина не будет освобождена, а израильское присутствие на этих землях не закончится.
12 мая агентство United Press International опубликовало сообщение о том, что есть информация из высокопоставленного израильского источника. Израиль предпримет ограниченную военную операцию, чтобы свергнуть сирийский военный режим, если сирийские террористы продолжат рейды с целью саботажа на территорию Израиля. Это было бы серьезным ударом против сирийского правительства.
13 мая правительство Египта получило официальное уведомление правительства СССР о том, что войска Израиля готовят нападение на Сирию. Датой предполагаемого нападения было названо 17 мая.
В этот же день, 13 мая, Сирия потребовала действий со стороны Египта для предотвращения предполагаемого нападения Израиля. 14 мая Египет мобилизовал все свои силы в зоне Суэцкого канала и вокруг.
15 мая, в День независимости Израиля, египетские войска были переброшены на Синай и начали концентрироваться у израильской границы.
16 мая Египет обвиняет Израиль в угрозе агрессии по отношению к Сирии и подтягивает к границе на Восточном Синае несколько дивизий. В этот же день, 16 мая, Египет требует от ООН вывести войска безопасности ООН, патрулировавшие линию прекращения огня 1948–1956 гг. Генеральный секретарь ООН У Тан пытается убедить правительство Египта отказаться от требования эвакуации войск. Он также просит у Израиля разрешения разместить войска ООН с израильской стороны границы, однако получает отказ от обоих правительств.
16 мая Израиль начинает мобилизацию. 17 мая в 8 часов утра по гринвичскому времени египтяне уже заняли все наблюдательные посты вдоль границы. В тот же день два египетских МиГа пролетели над территорией Израиля — с востока, из Иордании, на запад. Их полет прошел точно над израильским ядерным центром в Димоне. Перехватить их не успели. 17 мая начала мобилизацию Иордания.
18 мая, вскоре после полудня по гринвичскому времени, египтяне приказали отряду из 32 солдат ООН, занимавшему наблюдательные посты в Шарм-эш-Шейхе, эвакуироваться в течение 15 минут. Официальное египетское требование до сведения Генерального секретаря ООН У Тана было доведено лишь в 4 часа дня. У Тан немедленно отдает распоряжение вывести войска. В тот же день начинается мобилизация в Кувейте.
18 мая, после поспешного ухода сил ООН, каирское радио «Голос арабов» заявило следующее: «С сегодняшнего дня больше не существует чрезвычайных международных сил, защищающих Израиль. Мы более не будем проявлять сдержанность. Мы далее не будем обращаться в ООН с жалобами на Израиль. Единственным методом воздействия, который мы применим в отношении Израиля, станет тотальная война, результатом которой будет полное уничтожение сионистского государства».
Министр обороны Сирии Хафез Асад, годом раньше говоривший о необходимости сбросить евреев в море, выступил с таким заявлением: «Наши силы сейчас полностью готовы не только к отражению агрессии, но и к началу процесса освобождения, к уничтожению сионистского присутствия на арабской земле. Сирийская армия держит палец на спусковом крючке… Я, как военный человек, уверен, что пришло время вступить в войну на уничтожение». К 18 мая сирийская армия была полностью готова к боевым действиям в районе Голанских высот.
19 мая войска ООН выведены, в Израиле проводится частичная мобилизация. 20 мая частичная, по другим источникам — полная мобилизация в Израиле завершена.
21 мая в Египте объявлена всеобщая мобилизация. 22 мая президент Египта Насер, разместив гарнизон в Шарм-эш-Шейхе, объявляет блокаду пролива Эт-Тиран, закрыв израильский порт Эйлат.
23 мая Саудовская Аравия объявляет о готовности принять участие в военном конфликте, а Израиль заявляет, что «помехи, чинимые израильскому судоходству в проливе Эт-Тиран, будут рассматриваться как акт войны, равно как и вывод войск безопасности ООН (UNEF), отправка иракских войск в Египет и подписание военного пакта между Египтом и Иорданией». Он оставляет за собой право начать военные действия.
24 мая Иордания завершает мобилизацию. 25 мая военный министр Египта Шамс эд-Дин Бадран вылетает в Москву. Он просит у советского руководства разрешения атаковать Израиль. Однако председатель Совета Министров СССР Косыгин не дает одобрения для «превентивной атаки против Израиля», заявив, что «Советский Союз против агрессии». Вернувшись в Египет, Бадран информирует Насера, что СССР не разрешает Египту атаковать первым, но что обязуется вмешаться в военный конфликт в случае, если США вступят в войну на стороне Израиля. В связи с этим Насер информирует военное командование Египта, что Египет будет вынужден выдержать удар, который Израиль нанесет первым. Командующий ВВС Египта генерал Судки Махмуд заявляет Насеру, что такая тактика будет губительной.
26 мая Насер, обращаясь к руководителям панарабской федерации профсоюзов, сказал, что, если разразится война, «она будет тотальной и ее цель — уничтожение Израиля».