С августа 1991 года стал советником президента РСФСР по экономическим вопросам Ю.В. Скоков, позже работавший секретарем Совета безопасности (22 мая 1992 года — 10 мая 1993 года). Со временем он заимел много сторонников в регионах и стал значимой личностью, даже начал возражать своему патрону. В марте 1993 года Скоков вступил в открытый конфликт с президентом РФ, отказавшись завизировать проект президентского указа о введении Особого порядка управления страной, противоречащего действующей Конституции. Тогда Ельцин избавился от него.
В большую политику шагнул А.Б. Чубайс. Он 10 ноября 1991 года был назначен председателем Государственного комитета по управлению государственным имуществом и проработал на этой должности до 5 ноября 1994 года. Министр финансов Борис Федоров писал о нем: «Для характеристики Чубайса, на мой взгляд, наиболее подходят слова “железный”, “собранный”, “точный как часы”, “обязательный”. У большинства людей, имевших опыт общения с ним, он всегда вызывал уважение (но редко — симпатию). У оппонентов Чубайса его жесткость и целеустремленность вызывали ненависть, раздражение, но одновременно и уважение к его силе». Чубайс 1 июня 1992 года назначен заместителем председателя Правительства РФ по вопросам экономической и финансовой политике. Он также сохранил за собой прежний пост председателя Государственного комитета по управлению государственным имуществом. Администрация президента РФ стала таким же значимым то ли партийным, то ли государственным аппаратом, как ЦК КПСС. Ее сотрудники стали контролировать все другие органы власти, занимались подготовкой стратегических решений государственной политики. Вадим Печенов, работавший и в аппарате Администрации президента РФ, и ЦК КПСС, писал: «Мне бросилось в глаза, что этот аппарат меньше был готов к выполнению задач, которые перед ним ставились, чем аппарат ЦК. Президентская команда была перегружена огромным количеством документов».
Для Правительства РФ было гораздо сужено поле деятельности по сравнению с Советом Министром СССР не только потому, что обслуживало оно одну республику вместо бывших пятнадцати, но из-за ухода из-под его контроля многих приватизированных предприятий.
С силовыми министерствами на продолжение всей эпохи правления Ельцина проходила невообразимая чехарда, которая никак не способствовала спокойной профессиональной работе этих ведомств. Конституционный суд РФ 14 января 1992 года единогласно признал указ президента РФ «Об образовании Министерства безопасности и внутренних дел РСФСР» (слияние МВД и АФБ), подписанный 19 декабря 1991 года, не соответствующим Конституции РСФСР. На следующий день Ельцин отменил свое решение о создании Министерства безопасности и внутренних дел. В.В. Бакатин освобожден от должности руководителя Межреспубликанской службы безопасности СССР, В.В. Иваненко — генерального директора Агентства федеральной безопасности, А.Ф. Дунаев — министра внутренних дел; Виктор Баранников назначен председателем Агентства федеральной безопасности, Виктор Ерин — министром внутренних дел.
Президентский указ от 24 января 1992 года «Об образовании Министерства безопасности РФ» на базе Агентства федеральной безопасности и Межреспубликанской службы безопасности. Министром безопасности назначен В.П. Баранников.
Исполняющий обязанности министра обороны Павел Грачев 18 мая 1992 года назначен министром обороны. Он проработал на этой должности до 17 июня 1996 года. За эти годы не раз поднимали вопрос о злоупотреблениях и коррупции в армии, говорили о его профессиональной непригодности для столь высокого поста. Но Ельцин держал Грачева, как «защитника Белого дома» в августе 1991 года. Генерал армии Игорь Родионов говорил: «Грачев у меня в 40-й армии был хорошим командиром дивизии ВДВ. Выше этого уровня он так и не поднялся. Министром же он стал лишь потому, что вовремя перебежал на сторону Ельцина».
Павел Вощанов в середине февраля 1992 года подал заявление об отставки с поста пресс-секретаря президента РФ. Во время августовского путча 1991 года он проводил пресс-конференции в стенах «Белого дома» на Краснопресненской набережной, готовил речи Ельцина, прятал его родственников в своей квартире. Но личные разногласия с Ельциным нарастали, что и послужило причиной его отставки. Вощанов писал: «Самый запомнившийся эпизод — это ночь с 20 на 21 августа 1991 года. В этом были и трагедия, и фарс. Трагедия — это люди, находившиеся вокруг Белого дома, а фарс — происходившее в то же самое время в его подвалах. Отцы русской демократии праздновали там победу над Горбачевым. Именно тогда я первый раз в жизни понял, что служу не тому человеку».
На арену политической и экономической жизни страны выходит Егор Гайдар, назначенный 22 февраля 1992 года министром экономики (до 2 апреля). Следом 2 марта он назначен первым заместителем председателя Правительства РФ, с 15 июня по 15 декабря 1992 года — исполняющий обязанности председателя Правительства РФ. Ему пришлось уйти в отставку, что стало компромиссом в отношениях президента и Верховного Совета РФ.
Пресс-секретарем президента РФ 14 мая 1992 года назначен Вячеслав Костиков. Кинооператор президента РФ А.О. Кузнецов вспоминал: «Самым веселым человеком в Администрации первого президента России был третий по счету пресс-секретарь Вячеслав Костиков… Его общение с прессой сопровождалось экстравагантными высказываниями, и если о пресс-секретарях обычно говорили, что они являются устами своих хозяев, то Славу сравнивали, ввиду его неординарных выступлений, с другой частью тела. Из всех пресс-секретарей Костиков был самым непредсказуемым».
В.М. Лопухин 30 мая 1992 года освобожден от обязанностей министра топлива и энергетики. Е.Т. Гайдар вспоминал: «Совещание в Кремле по проблемам нефтегазового комплекса с приглашением руководителей ведущих предприятий. Предстоит обсудить ход реформ в этой важной сфере, финансовое положение предприятий, работу по реструктурированию нефтедобывающих и нефтеперерабатывающих объединений. Министр топлива и энергетики В. Лопухин, подготовивший к совещанию несколько важных, основополагающих документов, должен сделать доклад. Но, открывая совещание, президент сообщает, что принял решение освободить В. Лопухина от должности, а заместителем председателя правительства по топливно-энергетическому комплексу назначить председателя концерна “Газпром” В. Черномырдина». Так на арене политической жизни страны появилась еще одна значимая фигура.
Президентский указ от 15 июня 1992 года об освобождении себя от обязанностей председателя Совета Министров (Правительства) РФ и о назначении Егора Гайдара исполняющим обязанности председателя Правительства РФ. В результате проведенных им реформ население лишилось своих сбережений, либерализация цен привела к обнищанию почти всего населения страны и вызвало острое социальное напряжение. Съезд народных депутатов в декабре 1992 года не утвердил его в должности председателя Совета Министров (Правительства) РФ. После ухода 16 декабря в отставку он возглавил созданный специально для него Институт проблем экономики переходного периода и остался консультантом президента РФ.
