Ответ Сталина не был спонтанным – как мудрый национально ориентированный политик, он мог ожидать подобного поворота. Недаром в 1942 году на эвакуированной в Алма-Ату студии «Мосфильм» продолжились начатые еще в 1941 году съемки эпохальной ленты «Иван Грозный». Сохранилась стенограмма беседы Сталина и Молотова с режиссером фильма Сергеем Эйзенштейном и исполнителем главной роли Ивана Грозного Николаем Черкасовым, где Эйзенштейна критикуют за отсутствие показа опричнины как нового слоя феодалов, на который опирался царь Иван Грозный. В ответ Эйзенштейн заверил, что примет критику к сведению.
В самом деле, в ходе Ливонской войны лучший полководец Ивана Грозного по имени Андрей Курбский – в дальнейшем Андрей Власов станет его реинкарнацией – бежит в Литву, переходит на службу к великому князю литовскому и вскоре после своего предательства, осенью 1564 года, ведет войска на Москву. И уже в начале декабря 1564 года, согласно Генриху фон Штадену, была предпринята попытка вооружённого мятежа против Ивана Грозного, в которой принимали участие прозападные силы: «Многие знатные вельможи собрали в Литве и в Польше немалую партию и хотели с оружием идти против царя своего».
В этой ситуации Иван Грозный принимает следующее решение. 3 декабря 1564 года он внезапно уезжает из Москвы в Александровскую слободу и 3 января 1565 года объявляет о своём отречении от престола. Через два дня к нему прибывает делегация во главе с архиепископом Пименом, которая уговаривает его вернуться на царство. 3 февраля Иван Грозный объявляет, что вновь принимает на себя правление, но при условии, чтобы ему вольно было казнить изменников, лишать их имущества, для чего учредить в государстве опричнину (от слова «опричь», «особый»), которая явилась первой на Руси спецслужбой, «особым отделом». В опричнину было набрано 1000 человек из «опричных» уездов, не имеющих родственных и служебных связей со знатными боярами. В дальнейшем число опричников достигло 6000 человек. Эти люди в случае необходимости служили в роли доверенных царских порученцев, осуществлявших охранные, разведывательные, следственные и карательные функции. Они действительно были «особистами» – физически крепкие, решительные, наделенные особыми полномочиями, в черных кафтанах, на вороных конях, украшенных черной сбруей – вид у царских слуг был устрашающим. Неизменным атрибутом опричников были метла и песья голова, которыми «декорировалось» седло. Символы давали понять, что любой государев изменник будет по-собачьи «выгрызен» и «выметен» поганой метлой.
Так же поступил и Сталин. Вскоре после выхода Смоленского воззвания Андрея Власова он забирает Особые отделы из НКВД и 19 апреля 1943 года создает на их основе Главное управление контрразведки «Смерш», подчиненное непосредственно ему как народному комиссару обороны. Во главе опричнины и в качестве своего заместителя он ставит комиссара госбезопасности 2-го ранга (генерал-полковника) Виктора Семёновича Абакумова, до этого возглавлявшего Управление особых отделов НКВД СССР. В тот же день заместителем начальника ГУКР «Смерш» был назначен комиссар госбезопасности 3-го ранга (генерал-лейтенант) Николай Николаевич Селивановский.
В центральном аппарате «Смерша» служило 646 человек, которые размещались в здании на Лубянке на 4-м и 7-м этажах. Под руководством Абакумова «Смерш» превратился в сверхмощное ведомство и стал самой эффективной спецслужбой времен Второй мировой войны, напрочь перекрыв все каналы для вражеских диверсантов и государственной измены.
В состав ГУКР «Смерш» с апреля 1943 года входили следующие отделы:
• 1-й отдел – агентурно-оперативная работа в центральном аппарате Наркомата обороны (начальник полковник, затем генерал-майор Горгонов Иван Иванович);
• 2-й отдел – работа среди военнопленных, проверка военнослужащих Красной Армии, бывших в плену (начальник подполковник Карташев Сергей Николаевич);
• 3-й отдел – борьба с агентурой, забрасываемой в тыл Красной Армии (начальник полковник Утехин Георгий Валентинович);
• 4-й отдел – работа на стороне противника для выявления агентов, забрасываемых в части Красной Армии (начальник полковник Тимофеев Петр Петрович);
• 5-й отдел – руководство работой органов «Смерш» в военных округах (начальник полковник Зеничев Дмитрий Семенович);
• 6-й отдел – следственный (начальник подполковник Леонов Александр Георгиевич);
• 7-й отдел – оперативный учет и статистика, проверка военной номенклатуры ЦК ВКП(б), НКО, НКВМФ, шифрработников, допуск к совершенно секретной и секретной работе, проверка работников, командируемых за границу (начальник полковник Сидоров А.Е. – был назначен позднее);
• 8-й отдел – оперативной техники (начальник подполковник Шариков Михаил Петрович);
• 9-й отдел – обыски, аресты, наружное наблюдение (начальник подполковник Кочетков Александр Евстафьевич);
• 10-й отдел «С» – специальных заданий (начальник майор Збраилов Александр Михайлович);
• 11-й отдел – шифровальный (начальник полковник Чертов Иван Александрович);
• Политотдел – начальник полковник Сиденьков Никифор Матвеевич;
• Отдел кадров – начальник полковник Врадий Иван Иванович;
• Административно-финансово-хозяйственный отдел – начальник подполковник Половнев Сергей Андреевич;
• Секретариат – начальник полковник Чернов Иван Александрович.
За три года существования «Смерша» в его рядах не было ни одного случая предательства, перехода на сторону врага. На счету «Смерша», по самым скромным подсчетам, более 30 тыс. разоблаченных немецких агентов, почти 4 тыс. организаторов и исполнителей диверсий, более 6 тыс. террористов. Свыше 3 тыс. агентов «Смерша» было заброшено в тыл врага. Органы «Смерша» провели 183 радиоигры. Подобного размаха не знала ни одна спецслужба в мире.
7 мая 1946 года Абакумов был назначен министром государственной безопасности СССР. Ему было 38 лет. Вечерами он любил ходить по улице Горького пешком, со всеми любезно здоровался, а его адъютант раздавал старушкам рублёвые ассигнации. Они крестились и благодарили. Главное управление контрразведки «Смерш» вошло в МГБ СССР в качестве 3-го Главного управления, которое возглавил Селивановский, – он же стал заместителем министра госбезопасности СССР.
Элиту нового министерства теперь составляли контрразведчики, выдвинувшиеся в годы войны, – разведка отошла в тень. Начальником 2-го Главного управления (контрразведка) МГБ СССР стал 31-летний саратовец Евгений Петрович Питовранов. Он же стал и заместителем министра. Даже разведку возглавил контрразведчик – начальником 1-го Главного управления (внешняя разведка) стал профессиональный контрразведчик Пётр Васильевич Федотов. В руках людей Абакумова сосредоточилось огромное количество компромата на высокопоставленных военных, партийных аппаратчиков и чиновников, замешанных в злоупотреблениях властью, воровстве и взяточничестве, что неизбежно вело к конфликту интересов и открытому столкновению.
12 июля 1951 года Абакумов был арестован по обвинению в государственной измене, сионистском заговоре в МГБ и попытках воспрепятствовать разработке «Дела врачей». Поводом для ареста послужил донос, написанный старшим следователем по особо важным делам подполковником Рюминым. 26 августа 1951 года со своих постов был смещен Селивановский и 2 ноября арестован по «делу Абакумова».