Глоссарий
ADA – аденозиндезаминазная недостаточность, метаболическое заболевание, вызывающее иммунный дефицит. Дети, страдающие таким заболеванием, не в состоянии противостоять патогенам, в силу чего вынуждены находиться в стерильных «палатках». ADA используется как модель в генной терапии.
ALU – повторяющийся короткий регуляторный элемент ДНК, не содержащий генетическую информацию и оказывающий регуляторный эффект на соседние гены; принадлежит к семейству ретроэлементов SINE. В геноме человека содержится 1,1 млн копий ALU (10,7% от всей последовательности); представлен главным образом в геномах приматов.
Argonaute – фермент, предназначенный для сайленсинга генной экспрессии и состоящий из доменов PAZ и PIWI (так же как обратная транскриптаза и РНКаза Н ретровирусов) в РНК-индуцированном комплексе сайлесинга (RISC). Белки семейства Argonaute связывают небольшую некодирующую РНК, которая затем направляет этот комплекс к РНК-мишени для ее расщепления.
Cas9 – CRISPR-ассоциированный белок 9, молекулярные «ножницы», разрезающие фрагмент ДНК в гибридах ДНК–РНК; обеспечивает защиту от ДНК-содержащих фагов в бактериях и археях, содержит РНКаза Н-подобные DDE (ДДЭ) аминокислоты в активном центре (ДНКаза Н, разрезающая ДНК в РНК–ДНК-гибридах).
CCR5 – рецептор для сигнальных молекул (хемокинов) на поверхности клеток человека, корецептор CD4-рецептора для ВИЧ, необходимый для внедрения в клетку-хозяина; лимфоцит с рецептором CD4 или макрофаг с CCR5 – первая мишень ВИЧ; позднее происходит инфицирование клеток, имеющих еще один рецептор СXCR4.
CONRAD и MTN-030/IPM 041 – акроним («Исследование и разработка контрацептивных средств»), содержит результаты, подтверждающие данные клинических исследований, препаратов для лечения ВИЧ-инфекции, в частности MTN-030/IPM 041 – исследование микробицидов во влагалище.
CpG – сокращение, обозначающее два нуклеотида, C (цитозин) и G (гуанин), связанные между собой при помощи фосфоэфирных мостиков в ДНК-молекулах; это важный мотив для эпигенетической регуляции в качестве мишеней метилирования.
CRISPR/Cas9 – короткие палиндромные кластерные повторы с регулярными промежуточными пространствами / CRISPR-ассоциированный белок 9; это противовирусная система защиты от внедрения ДНК-содержащих фагов в бактерии и археи. Данная технология используется для удаления и модификации генов, называется «редактирование» и является новым методом, предусматривающим очень серьезные потенциальные изменения генов во всех видах. Метод прост в использовании и отличается быстродействием и низкой ценой, не предполагает применения рекомбинантных механизмов, поскольку «направляющая» РНК «предназначает» новую последовательность, которая затем копируется (редактируется). Метод не предусматривает генетическую модификацию ДНК, не подпадает под законодательство, регулирующее ГМО; по этому поводу возникают этические споры.
CXCR4 или CCR5 – рецепторы, локализующиеся на лимфоцитах, которые позволяют поверхностным гликопротеинам ВИЧ (gp120) связываться и проникать в клетку на ранней и поздней стадиях заболеваний.
EHEC (энтерогеморрагический штамм кишечной палочки) – бактерия Escherichia coli, вызывающая энтерогеморрагические заболевания; является следствием фаг-опосредованного приобретения токсина (токсин Шига), который находится в фекалиях животных и удобрениях. Бактерия опасна для здоровья человека – ростки, зараженные EHEC, вызвали в Германии самый крупный скандал
[22], связанный с пищевыми продуктами.
EMBO – Европейская организация по молекулярной биологии, находится в Гейдельберге (Германия), занимается проведением научных мероприятий на высоком уровне, семинаров, учреждает стипендии, осуществляет подготовку специалистов как из Европы, так и из других стран мира.
EMEA – Европейское агентство по оценке лекарственных средств, занимающееся оценкой медицинских продуктов, защитой здоровья животных и человека, дает разрешение на проведение клинических исследований. До недавнего времени называлось EMA (Европейское агентство лекарственных средств).
Emiliania huxleyi – морские водоросли, содержащие углерод (кокколитофы), сокращенно называются EH, в зависимости от климата могут образовывать огромные светящиеся «поляны», являются носителями вирусов морских водорослей EhV или EHV, в результате лизирующего действия которых водоросли перестают светиться, что является стрессовой реакцией на снижение температуры и приводит к повторному использованию питательных веществ.
Erb-B2 или HER2/neu – онкоген (рак-промотирующий ген) вируса эритробластоза у цыплят, рецептор эпидермального фактора роста, который стимулирует пролиферацию клеток за счет задействования сигнального каскада Ras-MAP-киназы, характеризуется сверхэкспрессией, является индикатором рака молочной железы у человека. У 25% пациенток с раком молочной железы отмечаются мутации Erb-B2.
ERV – эндогенный ретровирус, ДНК которого интегрирована в геном эукариотов; наследуется как ДНК провируса через зародышевые клетки. Этот ретровирус более не является инфекционным и часто бывает дефектным. Возникает при заражении зародышевых клеток ранее не инфекционными вирусами, которые часто относятся к вымершим; обеспечивает противовирусную защиту от аналогичных вирусов. В настоящее время в реальном времени происходит эндогенизация данного вируса в организме коал, которые отождествляются с законсервированными (устойчивыми) сайтами интеграции, в то время как новые инфицирующие вирусы интегрируются на случайных сайтах (см. Phoenix).
ETH (Eidgenössische Technische Hochschule) – Швейцарский федеральный технологический институт (Цюрих), также называемый политехническим, является одним из ведущих европейских университетов.
FTO – белок, ассоциированный с жировой массой тела и ожирением, один из нескольких генов, ассоциированных с ожирением; ген имеет 47 000 нуклеотидов; это не один белок, а много вариантов из-за различного сплайсинга; действует совместно с транскрипционным фактором IXR3, ассоциированным с ожирением.
gag – один из ретровирусных генов, групп-специфический антиген; название основано на иммунологии вирусов.
GALV – вирус лейкоза гиббона, обезьяний вирус, убивший большое количество коал, прежде чем их организм выработал резистентность к данному вирусу путем эндогенизации.
Gypsy – название ретротранспозона, который очень напоминает ретровирус и присутствует у дрозофил, эквивалентен Ty3 в дрожжах, содержит длинные концевые повторы (LTR-последовательности), gag, pol, нуклеазу, интегразу, но не содержит ген env; может осуществлять перенос генов.
HBV – вирус гепатита В, параретровирус, который реплицируется при помощи обратной транскриптазы, но в вирусных частицах упакована ДНК, а не РНК, что в ряде случаев приводит к развитию гепатоцеллюлярной карциномы. Существует соответствующая вакцина.
HCV – вирус гепатита С. На поздней стадии заболевания может вызвать гепатоцеллюлярную карциному. Существует новая терапия (дорогостоящая – $50 000), которая весьма эффективно уничтожает вирус.
