«Пенистые» вирусы – параретровирусы, у которых жизненный цикл несколько отличается от жизненного цикла ретровирусов. Осуществляют обратную транскрипцию от вирусной РНК к провирусной ДНК перед тем, как вирус покинет клетку, а не перед внедрением в нее. Таким образом, сгруппированный вирусный геном представляет собой ДНК, а не РНК, как у ретровирусов. Другими параретровирусами являются вирус гепатита B (HBV) или вирусы растений, например вирус мозаики цветной капусты. Они упаковывают ДНК в вирусные частицы и поэтому на первый взгляд не похожи на ретровирусы.
Пептид – короткий белок.
Первичный бульон – термин, введенный Чарлзом Дарвином для описания условий внешней среды
[24], существовавших на первых этапах формирования жизни на Земле, в которых возникли первые биомолекулы и жизнь. По определению Джона Сазерленда, в его состав могут входить цианид водорода, сульфид водорода, фосфат и вода – все они под воздействием источника энергии, в частности ультрафиолета, могут обусловить формирование строительных блоков жизни, таких как аминокислоты, нуклеиновые кислоты и липиды.
ПКП (PEP) – постконтактная профилактика, которая предусматривает проведение антиретровирусной терапии в течение от четырех до 24 или 72 часов в зависимости от препарата для предотвращения ВИЧ-инфекции, несмотря на наличие половых контактов («утро после таблетки»).
Плазмиды – «голые» (неассоциированные белки, см. хроматин) кольцевые двухцепочечные ДНК внутри клеток (главным образом бактерий), могут переносить гены из одной клетки в другую; одним из таких примеров является Ti-плазмида Agrobacterium tumefaciens, которая индуцирует развитие опухоли у растений и лежит в основе генной терапии растений; вакцины на основе ДНК плазмиды кодируют белки/антитела, продуцируемые реципиентом после инъекции.
Плацента – слой клеток, отделяющий иммунную систему матери от эмбриона; см. синцитин.
Поли-ДНК-вирус – вирус насекомых, несущий 30 ДНК-плазмид из ДНК хозяина, кодирующий токсины и другие белки; имеет симбиотические отношения с осами; вирусные частицы не содержат вирусный геном, который вместо этого интегрируется в геномы ос; вирус передается вместе с яйцами насекомых, которые откладываются в живых гусеницах, что помогает прокормить личинок ос, уничтожая гусениц и используя их в качестве пищи, для чего задействуются транспортируемые гены токсинов, что напоминает механизм вирусных векторов при генной терапии.
Полимераза – фермент, необходимый для синтеза (полимеризации) биополимеров, в частности, нуклеиновых кислот, которые нужны для репликации ДНК или РНК в клетках и вирусах; обратная транскриптаза определяется как РНК-зависимая ДНК-полимераза.
Полимеразная цепная реакция – см. ПЦР.
Пребиотик – см. пробиотик.
Прион – понятие, состоящее из двух слов, а именно «белок» (protein) и «инфекция» (infection), обозначающее белковый инфекционный агент, состоящий «только из белка» и не имеющий нуклеиновых кислот. Прионовые белки, которые естественным образом присутствуют в тканях головного мозга, под действием средовых или генетических факторов или инфекции могут стать «неправильно свернутыми» наряду с другими неправильно свернутыми прионами; неправильное сворачивание (misfolding) приводит к агрегации прионов и развитию нейродегенеративных заболеваний. Здоровые прионные белки, называемые PrP, имеют структуры, отличные от тех, у которых сворачивание вызывает развитие заболеваний (PrPSc возникает из-за болезни скепи у овец, вызываемой неправильно свернутыми прионами); у них больше складчатых бета-слоев и меньше альфа-изгибов. В 1997 г. первооткрыватель прионов Стенли Прузинер стал лауреатом Нобелевской премии. Инфицирование человека прионами может происходить при потреблении мяса. Прион является возбудителем губчатой энцефалопатии крупного рогатого скота (ГЭКРС) (коровье бешенство), или куру (заболевание, ранее наблюдавшееся в племенах каннибалов в Папуа – Новой Гвинее), или скепи у овец; обобщенное название этих инфекционных заболеваний – ТГЭ (трансмиссивная губчатая энцефалопатия).
Пробиотик – часто живые бактерии, содержащиеся в йогуртах или молочных продуктах, которые попадают в кишечник. В отличие от них, пребиотики – специализированные неперевариваемые растительные волокна, которые действуют как удобрение для «хороших бактерий», которые там уже имеются.
Провирус (ДНК-содержащий) – промежуточная ДНК ретровирусов как важный этап репликации; интегрируется в ДНК клетки-хозяина на случайно выбираемых участках, наследуется в процессе деления клеток; название относится к ДНК-профагу.
Прокариоты – клетки, не имеющие ядра, бактерии или археи, в отличие от эукариотических клеток, у которых есть ядро.
Простейшие (протисты) – одноклеточные микроскопические эукариотические организмы, в том числе водоросли, слизистая плесень, в ряде случаев к их числу относят некоторых многоклеточных и микробиомных эукариотов; неформальное классифицирование разнообразных эукариотических организмов, за исключением животных, грибов и растений.
Профаг (ДНК-) – промежуточная ДНК в жизненном цикле ДНК-фагов, которые интегрируются в ДНК бактерии-хозяина.
«Прыгающий» ген, или транспозируемый элемент (ТЭ) – транспозон (подчиняется механизму «вырезать и вставить») или ретротранспозон (подчиняется механизму «копировать и вставить»), которые двигаются внутри клеточного ядра, влияя на геном; являются дефектными вирусными элементами, не имеют оболочки и «заперты» внутри клеток, составляют 45% генома человека. «Прыжки» генов вызывают изменение генетического материала. Способность к «прыжкам» регулируется эпигенетическими эффектами, может носить инновационный характер и оказаться опасной для генома и организма; контролируется механизмом сайленсинга (siРНК), который ограничивает двигательную подвижность этих элементов.
ПЦР – полимеразная цепная реакция, высокочувствительный метод амплификации молекул ДНК, который может использоваться в диагностике для выявления нуклеиновых кислот, включая мутации. Метод позволяет выполнять количественную оценку ДНК; процедура осуществляется в термоциклере, то есть в аппарате, где ДНК-содержащий образец сначала «расплавляется» и становится одноцепочечным, а затем копируется при помощи фермента ДНК-полимеразы, чтобы из каждой цепочки получить две (для этого используется стартер/праймер). Расплавление и копирование повторяются 20–60 раз, и число копий увеличивается в геометрической прогрессии (1, 2, 4, 8, 16 и т.д.). Количественная реакция, включающая предварительную обратную транскрипцию РНК в ДНК, например для выявления РНК ВИЧ, называется количественной ПЦР в реальном времени. Этот метод анализа используется очень часто. Резистентная к теплу ДНК-полимераза – это Taq-полимераза, при этом Taq в названии означает бактерию Thermus aquaticus, и ее использование повысило эффективность ПЦР.
